76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1374 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1374  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
218 aa  436  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.650648  normal  0.319866 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3005  transcriptional regulator, MarR family  62.67 
 
 
216 aa  249  2e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00979308  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0588  transcriptional regulator, MarR family  62.21 
 
 
218 aa  246  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1852  transcriptional regulator, ArsR family  61.5 
 
 
223 aa  237  8e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.211312 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2977  transcriptional regulator, ArsR family  61.29 
 
 
219 aa  236  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0909  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
228 aa  134  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000018626  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2633  ArsR family transcriptional regulator  36.74 
 
 
206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0612  ArsR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1711  regulatory protein, ArsR  56 
 
 
213 aa  91.7  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.851073 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1236  ArsR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.348841  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1567  regulatory protein, ArsR  32.27 
 
 
207 aa  87  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2059  transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0682  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 
97 aa  59.3  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1464  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 
97 aa  55.8  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 
105 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
117 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6743  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
137 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.661837 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  40.3 
 
 
105 aa  49.7  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  43.64 
 
 
115 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
105 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 
188 aa  46.6  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  36.92 
 
 
107 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
112 aa  46.2  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
192 aa  45.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
123 aa  45.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  33.33 
 
 
106 aa  45.4  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1986  transcriptional regulator, TrmB  45.28 
 
 
102 aa  45.1  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0836  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 
101 aa  44.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2275  ArsR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
105 aa  45.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_876  transcriptional regulator, ArsR family  44.23 
 
 
112 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
107 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3344  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
130 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
134 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  35.82 
 
 
121 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 
109 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2186  transcriptional regulator, ArsR family  39.68 
 
 
105 aa  43.5  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000631011  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
121 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2130  transcriptional regulator, ArsR family  32.29 
 
 
116 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
112 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3509  regulatory protein, ArsR  38.36 
 
 
116 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2910  regulatory protein, ArsR  35.29 
 
 
99 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
118 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8471  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 
130 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 
485 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  44.64 
 
 
111 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4079  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
118 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0764894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 
99 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 
110 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2994  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 
99 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.566931  normal  0.0250812 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
111 aa  42.7  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2942  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 
99 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130788 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  36.23 
 
 
97 aa  42.7  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3099  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 
99 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 
106 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  36.92 
 
 
111 aa  42.4  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1887  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
127 aa  42.7  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4734  regulatory protein, ArsR  39.62 
 
 
118 aa  42.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194838  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 
110 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1801  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
108 aa  42.4  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0818  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
139 aa  42.4  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 
193 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  36.07 
 
 
114 aa  42.4  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  32.86 
 
 
120 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 
110 aa  42  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1330  regulatory protein, ArsR  43.02 
 
 
107 aa  42  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
109 aa  42  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  31.82 
 
 
113 aa  42  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
437 aa  42  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1366  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 
252 aa  42  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00019196  hitchhiker  0.000000026398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5816  transcriptional regulator, ArsR family  35.82 
 
 
129 aa  42  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 
118 aa  41.6  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
109 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
118 aa  41.6  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 
118 aa  41.6  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  37.7 
 
 
124 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  32.86 
 
 
113 aa  41.6  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>