118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0836 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0836  regulatory protein, ArsR  100 
 
 
101 aa  199  8e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3558  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.406985 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0433  regulatory protein, ArsR  38.38 
 
 
100 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1101  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00196595  hitchhiker  0.000145009 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3194  transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.847871  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1561  regulatory protein ArsR  33.7 
 
 
100 aa  64.7  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.442352  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0888  regulatory protein ArsR  38.82 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.844031  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3885  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
116 aa  57.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11439  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3509  regulatory protein, ArsR  31.18 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1488  regulatory protein ArsR  31.46 
 
 
104 aa  52  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.486972  normal  0.347049 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0749  FHA domain-containing protein  44.83 
 
 
256 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1954  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0543134  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7857  hypothetical protein  34.83 
 
 
293 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  35.62 
 
 
120 aa  50.4  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2666  FHA domain-containing protein  45.61 
 
 
263 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1330  regulatory protein, ArsR  40.51 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1986  transcriptional regulator, TrmB  34.02 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0612  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
204 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  29.59 
 
 
109 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  41.79 
 
 
330 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2904  putative transcriptional regulator  46.3 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  42.47 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0682  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0909  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 
228 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000018626  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 
125 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  39.66 
 
 
226 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1887  ArsR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1871  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
281 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  35 
 
 
266 aa  45.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1707  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 
119 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000753333  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  34.21 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 
116 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
120 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
120 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  37.04 
 
 
120 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  36.76 
 
 
126 aa  44.3  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
120 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1852  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
223 aa  44.7  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.211312 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0045  transcriptional regulator, ArsR family  37.74 
 
 
142 aa  44.7  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1374  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
218 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.650648  normal  0.319866 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 
183 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  33.67 
 
 
103 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1646  ArsR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  38.33 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
123 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  37.5 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1719  ArsR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1455  transcriptional regulator, ArsR family  27.91 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566564  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  43.33 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1464  transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9201  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.437211 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  29.41 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  35.53 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
228 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2718  regulatory protein, ArsR  34.94 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.29 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3443  response regulator receiver protein  35.06 
 
 
223 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  35.23 
 
 
109 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
341 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
105 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  27.38 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 
133 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  32.29 
 
 
120 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 
121 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1516  transcriptional regulator, ArsR family  39.06 
 
 
399 aa  42  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 
105 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3344  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 
218 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.670275  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  36.23 
 
 
172 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
101 aa  41.2  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  32.43 
 
 
186 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  32.89 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  37.29 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
341 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1274  ArsR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1541  ArsR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0806106  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
329 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  33.73 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  36.92 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  37.29 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  37.29 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  31.73 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  34.25 
 
 
127 aa  40.8  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  33.82 
 
 
114 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>