41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1455 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1455  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 122 aa  249  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3509  regulatory protein, ArsR  54.13 
 
 		 116 aa  127  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3885  ArsR family transcriptional regulator  53.21 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11439  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3194  transcriptional regulator, ArsR family  57.29 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.847871  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1887  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1954  transcriptional regulator, ArsR family  47.73 
 
 		 108 aa  87.8  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0543134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9201  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.437211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8713  transcriptional regulator, ArsR family  47.78 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0202623  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1488  regulatory protein ArsR  38.37 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.486972  normal  0.347049 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0641  hypothetical protein  54.9 
 
 		 72 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1101  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00196595  hitchhiker  0.000145009 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3558  ArsR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 97 aa  50.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.406985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1986  transcriptional regulator, TrmB  27.38 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0433  regulatory protein, ArsR  32.99 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1561  regulatory protein ArsR  31.91 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.442352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0836  regulatory protein, ArsR  27.96 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2592  regulatory protein ArsR  41.33 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.108396 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1330  regulatory protein, ArsR  31.17 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  41.94 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  43.08 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  41.27 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3428  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 228 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3539  transcriptional regulator, ArsR family  31 
 
 		 228 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  30.91 
 
 		 339 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2309  regulatory protein ArsR  38.46 
 
 		 114 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 		 305 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0888  regulatory protein ArsR  31.17 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.844031  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  30.53 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  27.45 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 117 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 117 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 117 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3245  transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 		 208 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  32.74 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3864  regulatory protein ArsR  40.85 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.325648 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 120 aa  40  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>