80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0433 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0433  regulatory protein, ArsR  100 
 
 
100 aa  194  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1561  regulatory protein ArsR  75.26 
 
 
100 aa  159  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.442352  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1101  ArsR family transcriptional regulator  73.96 
 
 
105 aa  147  4e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00196595  hitchhiker  0.000145009 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0836  regulatory protein, ArsR  38.38 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0888  regulatory protein ArsR  38.71 
 
 
93 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.844031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3558  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
97 aa  61.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.406985 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1330  regulatory protein, ArsR  32.61 
 
 
107 aa  55.1  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3885  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
116 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11439  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3509  regulatory protein, ArsR  35.8 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1986  transcriptional regulator, TrmB  30.85 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1488  regulatory protein ArsR  32.63 
 
 
104 aa  52  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.486972  normal  0.347049 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3194  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 
115 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.847871  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1887  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
127 aa  50.1  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5889  transcriptional regulator, ArsR family  49.02 
 
 
307 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1455  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566564  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
207 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 
110 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  38.71 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20640  regulatory protein ArsR  36.07 
 
 
310 aa  44.7  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
125 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0045  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 
142 aa  44.3  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2323  hypothetical protein  26.8 
 
 
127 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0166968  normal  0.857189 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3245  transcriptional regulator, ArsR family  44.83 
 
 
208 aa  43.9  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
109 aa  43.5  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  40.98 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5584  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 
307 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.107073 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1954  transcriptional regulator, ArsR family  29.89 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0543134  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2973  putative transcriptional regulator  43.1 
 
 
207 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.6 
 
 
111 aa  42.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
192 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  38.33 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  39.34 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  33.82 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 
222 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  31.17 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  33.33 
 
 
219 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  29.63 
 
 
226 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 
124 aa  41.6  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
220 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  32.32 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  35.19 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  36.21 
 
 
112 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3009  ArsR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
207 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 
168 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
221 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0229  regulatory protein, ArsR  28.74 
 
 
110 aa  41.2  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00808889 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3024  ArsR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
207 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2946  ArsR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
207 aa  40.8  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.958799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3257  ArsR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
207 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
221 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  31.17 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3255  transcriptional regulator, ArsR family  43.1 
 
 
207 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  33.9 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  37.1 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  32.39 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  28.75 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
86 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  40.82 
 
 
117 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 
110 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8127  transcriptional regulator, ArsR family  41.51 
 
 
209 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  35.59 
 
 
118 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
120 aa  40  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1222  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 
300 aa  40  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0111  regulatory protein ArsR  38.18 
 
 
260 aa  40  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0376512  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>