59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9201 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9201  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
109 aa  215  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.437211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1954  transcriptional regulator, ArsR family  73.33 
 
 
108 aa  154  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0543134  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8713  transcriptional regulator, ArsR family  62.11 
 
 
103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0202623  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3509  regulatory protein, ArsR  53.64 
 
 
116 aa  107  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3885  ArsR family transcriptional regulator  51.82 
 
 
116 aa  106  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11439  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3194  transcriptional regulator, ArsR family  51.58 
 
 
115 aa  97.1  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.847871  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1887  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
127 aa  94  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1455  transcriptional regulator, ArsR family  43.18 
 
 
122 aa  82  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566564  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1488  regulatory protein ArsR  46.43 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.486972  normal  0.347049 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0641  hypothetical protein  61.7 
 
 
72 aa  62.8  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3558  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
97 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.406985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1986  transcriptional regulator, TrmB  33.72 
 
 
102 aa  50.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1101  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00196595  hitchhiker  0.000145009 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1330  regulatory protein, ArsR  31 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0888  regulatory protein ArsR  29.21 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.844031  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  44.62 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2592  regulatory protein ArsR  47.62 
 
 
123 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.108396 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
142 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  40 
 
 
142 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
341 aa  44.3  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0803  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
181 aa  43.9  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
124 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0909  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
228 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000018626  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0946  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
171 aa  42.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0836  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  32.89 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  28.43 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  32.89 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  36.99 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
341 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 
119 aa  41.6  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  32.74 
 
 
130 aa  41.6  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  37.29 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  43.1 
 
 
109 aa  41.2  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  44.44 
 
 
341 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  32.26 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  32.39 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  34.48 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
98 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  35.79 
 
 
107 aa  40.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
118 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
107 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  44.83 
 
 
119 aa  40.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
118 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
118 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
115 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
340 aa  40  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1222  transcriptional regulator, ArsR family  35.09 
 
 
300 aa  40.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  32.98 
 
 
107 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
94 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  36.07 
 
 
110 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  40.98 
 
 
144 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>