42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1222 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1222  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 300 aa  617  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1102  transcriptional regulator, ArsR family  47.26 
 
 		 304 aa  286  4e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2895  transcriptional regulator, MarR family  42.12 
 
 		 322 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0512058  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20640  regulatory protein ArsR  42.23 
 
 		 310 aa  257  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5706  hypothetical protein  40.41 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476701  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5584  transcriptional regulator, TrmB  41.72 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.107073 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2711  regulatory protein ArsR  39.45 
 
 		 306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5889  transcriptional regulator, ArsR family  40.97 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6802  transcriptional regulator, ArsR family  40.97 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0888  regulatory protein ArsR  44.07 
 
 		 93 aa  52.4  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.844031  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3194  transcriptional regulator, ArsR family  46.03 
 
 		 115 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.847871  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  44.64 
 
 		 106 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  44.64 
 
 		 116 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3558  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 97 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.406985 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  37.31 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1488  regulatory protein ArsR  31.4 
 
 		 104 aa  45.8  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.486972  normal  0.347049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 103 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  30.3 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1936  transcriptional regulator, ArsR family  43.4 
 
 		 109 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 96 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1101  ArsR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 105 aa  45.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00196595  hitchhiker  0.000145009 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3509  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 116 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 115 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1887  putative transcriptional regulatory protein  40.79 
 
 		 188 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.471019  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 86 aa  43.9  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 87 aa  43.5  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 122 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 		 106 aa  43.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1954  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 108 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0543134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  32.76 
 
 		 113 aa  43.1  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  32.53 
 
 		 119 aa  42.7  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 132 aa  42.7  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 		 135 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 108 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 		 119 aa  42.7  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 114 aa  42.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 192 aa  42.7  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3885  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 116 aa  42.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11439  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1606  transcriptional regulatory protein, putative  39.47 
 
 		 188 aa  42.4  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00436475  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 103 aa  42.4  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>