50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5889 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5889  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
307 aa  634    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6802  transcriptional regulator, ArsR family  94.46 
 
 
307 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5706  hypothetical protein  59.66 
 
 
295 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476701  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5584  transcriptional regulator, TrmB  57 
 
 
307 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.107073 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2711  regulatory protein ArsR  51.63 
 
 
306 aa  359  4e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20640  regulatory protein ArsR  42.07 
 
 
310 aa  272  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2895  transcriptional regulator, MarR family  42.21 
 
 
322 aa  242  7e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0512058  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1102  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
304 aa  239  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1222  transcriptional regulator, ArsR family  40.97 
 
 
300 aa  237  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0229  regulatory protein, ArsR  38.67 
 
 
110 aa  55.8  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00808889 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1561  regulatory protein ArsR  50.98 
 
 
100 aa  50.8  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.442352  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0433  regulatory protein, ArsR  49.02 
 
 
100 aa  49.7  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1101  ArsR family transcriptional regulator  49.02 
 
 
105 aa  48.5  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00196595  hitchhiker  0.000145009 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
108 aa  46.2  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3442  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
91 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3201  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
91 aa  46.2  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00511684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3457  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
91 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3227  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
91 aa  46.2  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3479  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
91 aa  46.2  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3134  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
91 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.339641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1816  transcriptional regulator, ArsR family  34.43 
 
 
91 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98028  normal  0.175921 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3430  transcriptional regulator, ArsR family  34.43 
 
 
91 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  44.07 
 
 
287 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  33.78 
 
 
98 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
117 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 
93 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0148  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
91 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0048  transcriptional regulator, ArsR family protein  28.12 
 
 
92 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0663056  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
134 aa  43.5  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3120  ArsR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
88 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127966  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  34.33 
 
 
130 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3439  ArsR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
88 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2987  regulatory protein ArsR  30.86 
 
 
96 aa  43.5  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
120 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
103 aa  43.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
111 aa  42.7  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4339  ArsR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
96 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  34.92 
 
 
110 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4279  transcriptional regulator, ArsR family  32.31 
 
 
96 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0861  transcriptional regulator, ArsR family  32.31 
 
 
96 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4373  transcriptional regulator, ArsR family  32.31 
 
 
96 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4392  transcriptional regulator, ArsR family  32.31 
 
 
96 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  24.36 
 
 
945 aa  42.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4112  ArsR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
96 aa  42.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4010  ArsR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
100 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4000  ArsR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
100 aa  42.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  34.92 
 
 
110 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4483  ArsR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
172 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4161  ArsR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
172 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0906669  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
97 aa  42.4  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>