40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6802 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6802  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
307 aa  636    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5889  transcriptional regulator, ArsR family  94.46 
 
 
307 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5584  transcriptional regulator, TrmB  56.35 
 
 
307 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.107073 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5706  hypothetical protein  58.97 
 
 
295 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476701  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2711  regulatory protein ArsR  51.96 
 
 
306 aa  362  6e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20640  regulatory protein ArsR  42.07 
 
 
310 aa  271  8.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2895  transcriptional regulator, MarR family  40.83 
 
 
322 aa  237  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0512058  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1102  transcriptional regulator, ArsR family  39.66 
 
 
304 aa  238  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1222  transcriptional regulator, ArsR family  40.97 
 
 
300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0229  regulatory protein, ArsR  30.77 
 
 
110 aa  49.3  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00808889 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3120  ArsR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
88 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3442  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
91 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3457  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
91 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3227  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
91 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3439  ArsR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
88 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3134  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
91 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.339641  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3201  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
91 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00511684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3479  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
91 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3430  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
91 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1816  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
91 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98028  normal  0.175921 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
117 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0148  ArsR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
91 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4161  ArsR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
172 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0906669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4483  ArsR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
172 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2987  regulatory protein ArsR  30.86 
 
 
96 aa  46.2  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4112  ArsR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
96 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4279  transcriptional regulator, ArsR family  33.85 
 
 
96 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0861  transcriptional regulator, ArsR family  33.85 
 
 
96 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4373  transcriptional regulator, ArsR family  33.85 
 
 
96 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4392  transcriptional regulator, ArsR family  33.85 
 
 
96 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4010  ArsR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
100 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4000  ArsR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
100 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4339  ArsR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
96 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
126 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0160  transcriptional regulator, ArsR family  33.85 
 
 
101 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0048  transcriptional regulator, ArsR family protein  27.08 
 
 
92 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0663056  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 
96 aa  42.7  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 
93 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  23.72 
 
 
945 aa  42.7  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 
105 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>