122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5706 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5706  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  607  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476701  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5584  transcriptional regulator, TrmB  67.01 
 
 		 307 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.107073 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2711  regulatory protein ArsR  62.33 
 
 		 306 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5889  transcriptional regulator, ArsR family  59.66 
 
 		 307 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6802  transcriptional regulator, ArsR family  58.97 
 
 		 307 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20640  regulatory protein ArsR  44.07 
 
 		 310 aa  289  5.0000000000000004e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2895  transcriptional regulator, MarR family  43.49 
 
 		 322 aa  264  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0512058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1222  transcriptional regulator, ArsR family  40.41 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1102  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 304 aa  247  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 97 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  41.03 
 
 		 146 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 108 aa  52.4  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 107 aa  52.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  45.28 
 
 		 117 aa  52.4  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 116 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 116 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 97 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 96 aa  49.7  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  37.93 
 
 		 119 aa  48.9  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 89 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 116 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 121 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 115 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  37.35 
 
 		 109 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  39.56 
 
 		 110 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2987  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 		 96 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 93 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  46.15 
 
 		 111 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  43.55 
 
 		 127 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3227  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 91 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3201  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 91 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00511684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3134  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 91 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.339641  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3479  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 91 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 134 aa  47  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3457  transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 		 91 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3430  transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 		 91 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1816  transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 		 91 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98028  normal  0.175921 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3442  transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 		 91 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4339  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 96 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 250 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 250 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 250 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4112  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 96 aa  46.6  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4392  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 96 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4373  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 96 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0861  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 96 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4279  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 96 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 103 aa  46.2  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  35.62 
 
 		 98 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4161  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 172 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0906669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4483  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 172 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  33.72 
 
 		 108 aa  45.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 109 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  40.98 
 
 		 95 aa  45.4  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0945  transcriptional regulator, ArsR family  41.82 
 
 		 119 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5380  transcriptional regulator, ArsR family  43.4 
 
 		 117 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4000  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 100 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4010  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 100 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0148  ArsR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 91 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  35 
 
 		 113 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 126 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 114 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 95 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  47.17 
 
 		 138 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  39.34 
 
 		 95 aa  45.1  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  40.98 
 
 		 95 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  41.94 
 
 		 114 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  38.36 
 
 		 113 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 95 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 		 142 aa  44.3  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0191  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 124 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 109 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 109 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 125 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1723  transcriptional regulator  31.15 
 
 		 95 aa  43.9  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000132397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 127 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 122 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  32.43 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  42.37 
 
 		 125 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  46 
 
 		 113 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3120  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 88 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127966  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 109 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  39.62 
 
 		 109 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3439  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 88 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  43.64 
 
 		 164 aa  43.5  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  37.36 
 
 		 110 aa  43.5  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  39.66 
 
 		 114 aa  43.9  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 127 aa  43.5  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  46.43 
 
 		 138 aa  43.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 84 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2533  transcriptional regulator, ArsR family  38.57 
 
 		 120 aa  43.5  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02390  regulatory protein ArsR  33.75 
 
 		 95 aa  43.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  41.67 
 
 		 102 aa  43.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 95 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 95 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 95 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 117 aa  43.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 96 aa  43.1  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 		 95 aa  43.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 95 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>