More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0945 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0945  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 119 aa  238  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5228  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2994  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 297 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3425  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.461956  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1937  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2370  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000192814  hitchhiker  0.0000168087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5380  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 117 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  40.85 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  34.67 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  31.65 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  35 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0166  transcriptional repressor PagR  30.43 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  35.06 
 
 		 101 aa  52.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  31.33 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  32.53 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  30.77 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  31.33 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2839  metal-regulated homodimeric transcriptional regulator  32.89 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  37.88 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  33.33 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3740  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 124 aa  51.2  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 		 111 aa  50.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  28.05 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 116 aa  50.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5478  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.350529  hitchhiker  0.00151942 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  32.05 
 
 		 117 aa  50.8  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  32.65 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 		 116 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 102 aa  50.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.4 
 
 		 106 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  33.77 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 102 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  30.49 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  34.62 
 
 		 102 aa  50.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  28.4 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3941  regulatory protein ArsR  31.33 
 
 		 99 aa  50.1  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 102 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  28.4 
 
 		 114 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 114 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  34.62 
 
 		 102 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 102 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  28.4 
 
 		 114 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  34.62 
 
 		 102 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  35.53 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  32.18 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  37.31 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  38.67 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  32.47 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  34.33 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4262  ArsR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3398  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.88548  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  28.12 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  35.38 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  29.11 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4378  ArsR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0649635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  33.71 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  29.11 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>