More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1723 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1723  transcriptional regulator  100 
 
 		 95 aa  188  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000132397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  39.02 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  38.67 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2718  regulatory protein, ArsR  39.02 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  37.04 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  46.97 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  39.73 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  36.78 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  37.8 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  41.89 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  40.54 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  34.15 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  36.99 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1821  ArsR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0345143  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  30 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  34.15 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  33 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0052  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.135929  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 114 aa  52.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 117 aa  52.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  33.78 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4339  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4000  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 100 aa  52  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  36.59 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4010  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 100 aa  52  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3545  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.927906  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  36.59 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0861  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4373  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 		 120 aa  52  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  37.84 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4392  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4112  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 197 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4279  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  34.25 
 
 		 126 aa  52  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4161  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0906669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  32.89 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  34.09 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4483  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  32.18 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2987  regulatory protein ArsR  34.12 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  31.51 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  27.27 
 
 		 116 aa  50.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 121 aa  50.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>