101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3194 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3194  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 115 aa  229  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.847871  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3509  regulatory protein, ArsR  57.29 
 
 		 116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3885  ArsR family transcriptional regulator  55.21 
 
 		 116 aa  117  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11439  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1455  transcriptional regulator, ArsR family  57.95 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1887  ArsR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1954  transcriptional regulator, ArsR family  56.47 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0543134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9201  ArsR family transcriptional regulator  51.58 
 
 		 109 aa  97.1  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.437211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8713  transcriptional regulator, ArsR family  48.28 
 
 		 103 aa  87  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0202623  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0641  hypothetical protein  59.65 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3558  ArsR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.406985 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0836  regulatory protein, ArsR  37.23 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1488  regulatory protein ArsR  37.78 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.486972  normal  0.347049 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0888  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.844031  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1222  transcriptional regulator, ArsR family  46.03 
 
 		 300 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  50.85 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1986  transcriptional regulator, TrmB  31.82 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0433  regulatory protein, ArsR  33.7 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1274  ArsR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1101  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00196595  hitchhiker  0.000145009 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7857  hypothetical protein  35.53 
 
 		 293 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  39.34 
 
 		 339 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1561  regulatory protein ArsR  28.26 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.442352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  39.13 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  39.34 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 330 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1750  transcriptional regulator, ArsR family  29.76 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3867  regulatory protein ArsR  39.39 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248206  normal  0.706318 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  40.74 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1464  transcriptional regulator, ArsR family  45.28 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  36.92 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 146 aa  43.5  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 		 124 aa  43.5  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  40.74 
 
 		 120 aa  43.5  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  36.76 
 
 		 109 aa  42.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 118 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 118 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  42.59 
 
 		 103 aa  42.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  42.11 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  42.11 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0013  regulatory protein ArsR  29.58 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 		 120 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  36.51 
 
 		 119 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  38.33 
 
 		 111 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  36.51 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 122 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2186  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000631011  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  32.97 
 
 		 336 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  27.94 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0786  transcriptional regulator, ArsR family  27.03 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.965961 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  31.58 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0682  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  34.67 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 222 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  38.24 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1646  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  33.85 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 101 aa  40.4  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1359  ArsR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 225 aa  40.4  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.390289 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1374  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 218 aa  40.4  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.650648  normal  0.319866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.9 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2666  FHA domain-containing protein  30.38 
 
 		 263 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 437 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 132 aa  40  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 218 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0749  FHA domain-containing protein  35.21 
 
 		 256 aa  40  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 121 aa  40  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>