46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0559 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  100 
 
 		 116 aa  237  2.9999999999999997e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  73.68 
 
 		 116 aa  180  4.0000000000000006e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0723  transcriptional regulator, ArsR family  72.81 
 
 		 116 aa  173  7e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.532728  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1920  putative transcriptional regulator  73.68 
 
 		 116 aa  172  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5142  hypothetical protein  40.87 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1872  transcription regulator  38.05 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0352712 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3421  hypothetical protein  39.81 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1516  transcriptional regulator, ArsR family  41.74 
 
 		 115 aa  94  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.599896 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1221  hypothetical protein  36.75 
 
 		 117 aa  87  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3365  hypothetical protein  37.39 
 
 		 115 aa  84.3  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.753512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3712  hypothetical protein  35.24 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3278  transcriptional regulator, ArsR family  39.09 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1053  hypothetical protein  35.09 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.256423  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0641  transcription regulator  34.21 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2610  hypothetical protein  35.19 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00563905  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4287  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.91 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.132275  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1969  hypothetical protein  35 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  0.0475375 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2686  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.463238  normal  0.104568 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0407  hypothetical protein  36 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1979  hypothetical protein  36.36 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.219481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1236  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0736  hypothetical protein  32.73 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  34.83 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1741  hypothetical protein  31.82 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5175  hypothetical protein  43.06 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.937206  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3007  hypothetical protein  37.21 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0952791  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3591  hypothetical protein  32.73 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1662  hypothetical protein  31.82 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293702  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1750  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0946  hypothetical protein  30.84 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81682  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0245  hypothetical protein  29.91 
 
 		 111 aa  52.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.305068  normal  0.0996387 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0319  transcription regulator  27.78 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185486  normal  0.0870731 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0442  regulatory protein ArsR  29.41 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0877  putative transcriptional regulator  28.24 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.199532 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1306  hypothetical protein  28.12 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000189351 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0786  transcriptional regulator, ArsR family  27.59 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.965961 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0147  hypothetical protein  29.07 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5206  hypothetical protein  29.17 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0876  hypothetical protein  25.77 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.195647 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1706  regulatory protein ArsR  30 
 
 		 409 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3194  transcriptional regulator, ArsR family  27.94 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.847871  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3906  transcription regulator  27.06 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0738  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 		 415 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1362  hypothetical protein  28.57 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1152  hypothetical protein  25 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.314563 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2351  transcriptional regulator, ArsR family  31.18 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0391352  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>