44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5142 on replicon NC_013747
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013747  Htur_5142  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  233  5.0000000000000005e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3421  hypothetical protein  84.17 
 
 
119 aa  198  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3365  hypothetical protein  55.65 
 
 
115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.753512  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1221  hypothetical protein  54.7 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1516  transcriptional regulator, ArsR family  49.14 
 
 
115 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.599896 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3278  transcriptional regulator, ArsR family  49.14 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0641  transcription regulator  50.88 
 
 
114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0723  transcriptional regulator, ArsR family  45.22 
 
 
116 aa  100  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.532728  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1053  hypothetical protein  44.64 
 
 
119 aa  99.4  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.256423  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  42.61 
 
 
116 aa  97.1  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  40.87 
 
 
116 aa  95.9  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2610  hypothetical protein  42.98 
 
 
115 aa  92  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00563905  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0407  hypothetical protein  46.94 
 
 
118 aa  90.1  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1920  putative transcriptional regulator  40.71 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3712  hypothetical protein  41.96 
 
 
131 aa  87.4  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4287  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.59 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.132275  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1872  transcription regulator  37.38 
 
 
116 aa  78.2  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0352712 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  38.14 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1236  hypothetical protein  36.52 
 
 
151 aa  67  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3007  hypothetical protein  37.11 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0952791  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0736  hypothetical protein  38.26 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5175  hypothetical protein  39.58 
 
 
110 aa  62.8  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.937206  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1969  hypothetical protein  40.17 
 
 
131 aa  62  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  0.0475375 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1979  hypothetical protein  40.43 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.219481  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0786  transcriptional regulator, ArsR family  31.96 
 
 
107 aa  61.6  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.965961 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1750  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 
159 aa  61.6  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3591  hypothetical protein  32.41 
 
 
125 aa  57  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0147  hypothetical protein  29.13 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1662  hypothetical protein  31.48 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293702  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5206  hypothetical protein  30.97 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0442  regulatory protein ArsR  26.53 
 
 
112 aa  50.4  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2686  hypothetical protein  27.93 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.463238  normal  0.104568 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1741  hypothetical protein  32.61 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1306  hypothetical protein  31.82 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000189351 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0946  hypothetical protein  31.78 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81682  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3906  transcription regulator  33 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0319  transcription regulator  34.85 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185486  normal  0.0870731 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0441  hypothetical protein  29.9 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0245  hypothetical protein  29.91 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.305068  normal  0.0996387 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2339  hypothetical protein  31.03 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1152  hypothetical protein  21.59 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.314563 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
103 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1390  hypothetical protein  30.12 
 
 
118 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>