35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1979 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1979  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  247  4e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.219481  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0736  hypothetical protein  69.6 
 
 
125 aa  174  5e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3591  hypothetical protein  56.8 
 
 
125 aa  148  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1662  hypothetical protein  55.2 
 
 
125 aa  143  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293702  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1969  hypothetical protein  58.02 
 
 
131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  0.0475375 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5206  hypothetical protein  49.55 
 
 
121 aa  100  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2686  hypothetical protein  40.71 
 
 
119 aa  100  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.463238  normal  0.104568 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1236  hypothetical protein  41.28 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  50.63 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0319  transcription regulator  49.4 
 
 
129 aa  78.2  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185486  normal  0.0870731 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3906  transcription regulator  40.22 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  36.36 
 
 
116 aa  68.6  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1920  putative transcriptional regulator  37.27 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0723  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
116 aa  67  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.532728  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  35.59 
 
 
116 aa  64.7  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5142  hypothetical protein  40.43 
 
 
116 aa  61.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3421  hypothetical protein  32.73 
 
 
119 aa  61.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3365  hypothetical protein  32.43 
 
 
115 aa  60.1  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.753512  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0556  hypothetical protein  40.51 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1053  hypothetical protein  28.83 
 
 
119 aa  52  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.256423  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1872  transcription regulator  30.91 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0352712 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1516  transcriptional regulator, ArsR family  30.36 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.599896 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1221  hypothetical protein  26.61 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1750  transcriptional regulator, ArsR family  31.96 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3007  hypothetical protein  36.25 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0952791  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1306  hypothetical protein  34.33 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000189351 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3278  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0245  hypothetical protein  29.21 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.305068  normal  0.0996387 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2610  hypothetical protein  31.52 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00563905  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3712  hypothetical protein  30.63 
 
 
131 aa  43.9  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5175  hypothetical protein  35.63 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.937206  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4287  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.82 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.132275  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1390  hypothetical protein  27.66 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0407  hypothetical protein  28.26 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1152  hypothetical protein  29.63 
 
 
89 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.314563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>