46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0690 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  258  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3906  transcription regulator  40 
 
 
122 aa  87.4  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0736  hypothetical protein  45 
 
 
125 aa  80.1  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1979  hypothetical protein  50.63 
 
 
125 aa  79.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.219481  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1969  hypothetical protein  46.02 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  0.0475375 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1662  hypothetical protein  40.43 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293702  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3591  hypothetical protein  41.57 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1053  hypothetical protein  38.32 
 
 
119 aa  73.6  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.256423  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5142  hypothetical protein  38.14 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0319  transcription regulator  42.39 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185486  normal  0.0870731 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2686  hypothetical protein  40.66 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.463238  normal  0.104568 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5206  hypothetical protein  39.56 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1221  hypothetical protein  35.85 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1236  hypothetical protein  36.63 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1872  transcription regulator  41.18 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0352712 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3365  hypothetical protein  35.29 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.753512  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3421  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  34.83 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3007  hypothetical protein  34.82 
 
 
110 aa  63.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0952791  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1516  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
115 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.599896 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3712  hypothetical protein  31.25 
 
 
131 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4287  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.44 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.132275  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2610  hypothetical protein  32.32 
 
 
115 aa  60.1  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00563905  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5175  hypothetical protein  36 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.937206  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0641  transcription regulator  31.13 
 
 
114 aa  58.9  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0723  transcriptional regulator, ArsR family  31.46 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.532728  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1750  transcriptional regulator, ArsR family  27.27 
 
 
159 aa  53.9  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1920  putative transcriptional regulator  28.87 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0407  hypothetical protein  34.04 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  28.09 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1306  hypothetical protein  32.95 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000189351 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0464  hypothetical protein  23.28 
 
 
199 aa  48.9  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000221199 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0442  regulatory protein ArsR  26.44 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3278  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0877  putative transcriptional regulator  34.94 
 
 
110 aa  47.4  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.199532 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1741  hypothetical protein  32.22 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0245  hypothetical protein  35 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.305068  normal  0.0996387 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0147  hypothetical protein  26.88 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0946  hypothetical protein  35.29 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81682  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0876  hypothetical protein  28.92 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.195647 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1390  hypothetical protein  34.57 
 
 
118 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0556  hypothetical protein  37.65 
 
 
126 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1152  hypothetical protein  31.65 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.314563 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0146  hypothetical protein  29.17 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0441  hypothetical protein  29.21 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3986  transcriptional regulator, TrmB  32.84 
 
 
135 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.958939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>