26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0147 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0147  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  242  9.999999999999999e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0441  hypothetical protein  32.63 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1390  hypothetical protein  32.95 
 
 
118 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2339  hypothetical protein  30.68 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5142  hypothetical protein  29.13 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3421  hypothetical protein  29.7 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0146  hypothetical protein  29.47 
 
 
105 aa  52.8  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1221  hypothetical protein  29.35 
 
 
117 aa  51.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0946  hypothetical protein  32.89 
 
 
111 aa  50.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81682  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1516  transcriptional regulator, ArsR family  30.93 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.599896 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0442  regulatory protein ArsR  30.59 
 
 
112 aa  49.7  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0245  hypothetical protein  32.53 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.305068  normal  0.0996387 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1872  transcription regulator  25 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0352712 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0877  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.199532 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1306  hypothetical protein  30.59 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000189351 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5175  hypothetical protein  30.59 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.937206  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  29.07 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1053  hypothetical protein  28.26 
 
 
119 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.256423  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1145  CRISPR-associated DNA-binding protein  35.48 
 
 
240 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  26.88 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  25.58 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2555  hypothetical protein  32.95 
 
 
112 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.981859  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0723  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 
116 aa  42.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.532728  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1920  putative transcriptional regulator  28.24 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3365  hypothetical protein  25.81 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.753512  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0876  hypothetical protein  28.17 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.195647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>