10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1145 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1145  CRISPR-associated DNA-binding protein  100 
 
 		 240 aa  489  1e-137  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0266  CRISPR-associated Csa3 family protein  27.41 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.901503 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1358  transcriptional regulator, TrmB  25.12 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0845  regulatory protein IclR  38.89 
 
 		 261 aa  48.9  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.466192  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0403  hypothetical protein  44.44 
 
 		 212 aa  48.9  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.314168 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0201  hypothetical protein  42.86 
 
 		 207 aa  48.5  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0605671  normal  0.051825 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0147  hypothetical protein  35.48 
 
 		 119 aa  45.8  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1561  CRISPR-associated DNA-binding protein  23.33 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0591  hypothetical protein  43.14 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.948185 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1573  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  42.7  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>