33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0245 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0245  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  221  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.305068  normal  0.0996387 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0946  hypothetical protein  84.68 
 
 
111 aa  189  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81682  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2555  hypothetical protein  61.47 
 
 
112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.981859  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1390  hypothetical protein  49.52 
 
 
118 aa  100  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2339  hypothetical protein  52 
 
 
117 aa  100  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3712  hypothetical protein  36.04 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4287  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.78 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.132275  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0441  hypothetical protein  39.02 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  29.13 
 
 
116 aa  52.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  29.91 
 
 
116 aa  52.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1306  hypothetical protein  35.23 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000189351 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1872  transcription regulator  35.14 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0352712 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0442  regulatory protein ArsR  33.72 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0147  hypothetical protein  32.53 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1148  ArsR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
503 aa  48.9  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.591964  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1662  hypothetical protein  33.64 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293702  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1741  hypothetical protein  32.1 
 
 
139 aa  47  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1236  hypothetical protein  32.26 
 
 
151 aa  47  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0877  putative transcriptional regulator  40.38 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.199532 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1516  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 
115 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.599896 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  35 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0723  transcriptional regulator, ArsR family  30.1 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.532728  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3365  hypothetical protein  36.56 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.753512  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1920  putative transcriptional regulator  27.1 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1979  hypothetical protein  29.21 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.219481  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2610  hypothetical protein  34.69 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00563905  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1221  hypothetical protein  30.63 
 
 
117 aa  45.1  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0736  hypothetical protein  31.07 
 
 
125 aa  45.1  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3591  hypothetical protein  32.69 
 
 
125 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0146  hypothetical protein  40.38 
 
 
105 aa  43.5  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5142  hypothetical protein  29.91 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1969  hypothetical protein  33.77 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  0.0475375 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3421  hypothetical protein  31.19 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>