44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1920 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1920  putative transcriptional regulator  100 
 
 
116 aa  236  9e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0723  transcriptional regulator, ArsR family  86.21 
 
 
116 aa  209  7e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.532728  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  73.68 
 
 
116 aa  172  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  63.79 
 
 
116 aa  159  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5142  hypothetical protein  40.71 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3421  hypothetical protein  38.94 
 
 
119 aa  89  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1516  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 
115 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.599896 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1872  transcription regulator  37.74 
 
 
116 aa  81.3  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0352712 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0641  transcription regulator  39.47 
 
 
114 aa  80.9  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1221  hypothetical protein  35.9 
 
 
117 aa  77.8  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3365  hypothetical protein  38.94 
 
 
115 aa  75.5  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.753512  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2686  hypothetical protein  35.04 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.463238  normal  0.104568 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3278  transcriptional regulator, ArsR family  37.27 
 
 
114 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1053  hypothetical protein  35.96 
 
 
119 aa  70.1  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.256423  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3712  hypothetical protein  34.29 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1979  hypothetical protein  37.27 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.219481  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4287  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.02 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.132275  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2610  hypothetical protein  32.11 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00563905  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3591  hypothetical protein  34.55 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0407  hypothetical protein  33.33 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1236  hypothetical protein  34.51 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1662  hypothetical protein  33.64 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293702  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1969  hypothetical protein  30.83 
 
 
131 aa  60.5  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  0.0475375 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3007  hypothetical protein  39.08 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0952791  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1741  hypothetical protein  31.25 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  28.87 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5175  hypothetical protein  34.88 
 
 
110 aa  53.5  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.937206  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0736  hypothetical protein  28.95 
 
 
125 aa  53.5  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1750  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 
159 aa  53.5  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0738  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 
415 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0946  hypothetical protein  32.93 
 
 
111 aa  47  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81682  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0245  hypothetical protein  27.1 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.305068  normal  0.0996387 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0442  regulatory protein ArsR  25.26 
 
 
112 aa  44.3  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  29.51 
 
 
330 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5206  hypothetical protein  31.46 
 
 
121 aa  43.5  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2351  transcriptional regulator, ArsR family  30.34 
 
 
128 aa  43.5  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0391352  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  24.56 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0147  hypothetical protein  28.24 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1306  hypothetical protein  27.84 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000189351 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0464  hypothetical protein  23.58 
 
 
199 aa  41.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000221199 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2118  hypothetical protein  29.31 
 
 
283 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10405  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0319  transcription regulator  25.23 
 
 
129 aa  40  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185486  normal  0.0870731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>