39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3278 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3278  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 114 aa  226  9e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0641  transcription regulator  63.16 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3365  hypothetical protein  59.48 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.753512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1516  transcriptional regulator, ArsR family  54.78 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.599896 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3421  hypothetical protein  50 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5142  hypothetical protein  49.14 
 
 		 116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1221  hypothetical protein  44.92 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1053  hypothetical protein  45.87 
 
 		 119 aa  92  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.256423  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2610  hypothetical protein  45.87 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00563905  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0723  transcriptional regulator, ArsR family  43.64 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.532728  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0407  hypothetical protein  45.92 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  39.09 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  38.6 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1920  putative transcriptional regulator  37.27 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1872  transcription regulator  36.27 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0352712 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3712  hypothetical protein  40.59 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4287  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.74 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.132275  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0786  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.965961 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3591  hypothetical protein  37.5 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3007  hypothetical protein  37.65 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0952791  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1662  hypothetical protein  37.25 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293702  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5175  hypothetical protein  37.63 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.937206  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0736  hypothetical protein  37.5 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1236  hypothetical protein  39.8 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0319  transcription regulator  38.82 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185486  normal  0.0870731 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2686  hypothetical protein  30.34 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.463238  normal  0.104568 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  32.94 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1741  hypothetical protein  27.06 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1750  transcriptional regulator, ArsR family  35.82 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1979  hypothetical protein  33.71 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.219481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1969  hypothetical protein  35.71 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  0.0475375 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0442  regulatory protein ArsR  31.87 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0441  hypothetical protein  31.03 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2351  transcriptional regulator, ArsR family  32.98 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0391352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3906  transcription regulator  30.85 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2339  hypothetical protein  28.57 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1390  hypothetical protein  30.49 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  36.67 
 
 		 107 aa  40.4  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>