28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0786 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0786  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
107 aa  219  7e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.965961 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2610  hypothetical protein  38.3 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00563905  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1516  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.599896 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1750  transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3278  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 
114 aa  64.3  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5142  hypothetical protein  31.96 
 
 
116 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0407  hypothetical protein  33.73 
 
 
118 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3421  hypothetical protein  34 
 
 
119 aa  57.4  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1221  hypothetical protein  30.85 
 
 
117 aa  57.8  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3365  hypothetical protein  34.09 
 
 
115 aa  54.7  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.753512  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5175  hypothetical protein  30.69 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.937206  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0641  transcription regulator  32.65 
 
 
114 aa  53.9  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3712  hypothetical protein  31.91 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4287  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.132275  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0319  transcription regulator  28.57 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185486  normal  0.0870731 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  27.59 
 
 
116 aa  47  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3007  hypothetical protein  28.28 
 
 
110 aa  46.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0952791  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1662  hypothetical protein  31.07 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293702  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3591  hypothetical protein  31.07 
 
 
125 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1053  hypothetical protein  28.42 
 
 
119 aa  41.6  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.256423  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0723  transcriptional regulator, ArsR family  29.49 
 
 
116 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.532728  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2351  transcriptional regulator, ArsR family  28.12 
 
 
128 aa  41.2  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0391352  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3194  transcriptional regulator, ArsR family  27.03 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.847871  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0736  hypothetical protein  25.56 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1872  transcription regulator  28.57 
 
 
116 aa  40.4  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0352712 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1741  hypothetical protein  23.08 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3906  transcription regulator  26.14 
 
 
122 aa  40  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>