33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1750 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1750  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
159 aa  317  3e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1516  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 
115 aa  75.9  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.599896 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5175  hypothetical protein  38.83 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.937206  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1741  hypothetical protein  33.05 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0786  transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.965961 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3007  hypothetical protein  34.62 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0952791  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1221  hypothetical protein  34.34 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3712  hypothetical protein  34.62 
 
 
131 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
116 aa  61.6  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5142  hypothetical protein  37.97 
 
 
116 aa  61.6  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4287  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.19 
 
 
132 aa  61.2  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.132275  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3421  hypothetical protein  34.38 
 
 
119 aa  57.4  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2610  hypothetical protein  31.96 
 
 
115 aa  56.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00563905  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  36.71 
 
 
116 aa  55.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0723  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 
116 aa  55.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.532728  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3365  hypothetical protein  32.98 
 
 
115 aa  55.1  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.753512  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  27.27 
 
 
128 aa  53.9  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1872  transcription regulator  31.46 
 
 
116 aa  53.9  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0352712 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1920  putative transcriptional regulator  32.94 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2351  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 
128 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0391352  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0641  transcription regulator  32.58 
 
 
114 aa  52  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0407  hypothetical protein  27.59 
 
 
118 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1979  hypothetical protein  31.96 
 
 
125 aa  48.1  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.219481  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1053  hypothetical protein  28.57 
 
 
119 aa  48.1  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.256423  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3278  transcriptional regulator, ArsR family  35.82 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3194  transcriptional regulator, ArsR family  29.76 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.847871  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1662  hypothetical protein  33.66 
 
 
125 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293702  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1306  hypothetical protein  24.73 
 
 
116 aa  43.9  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000189351 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5206  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1969  hypothetical protein  32.05 
 
 
131 aa  42.4  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  0.0475375 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
126 aa  42  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3591  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  41.6  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0736  hypothetical protein  32.86 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>