42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1306 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1306  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  233  9e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000189351 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2339  hypothetical protein  35.87 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0441  hypothetical protein  35.63 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2610  hypothetical protein  30.53 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00563905  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1872  transcription regulator  32.67 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0352712 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1390  hypothetical protein  37.66 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0877  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.199532 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0245  hypothetical protein  35.23 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.305068  normal  0.0996387 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0946  hypothetical protein  35.16 
 
 		 111 aa  52  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81682  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0442  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1236  hypothetical protein  38.16 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0736  hypothetical protein  34.21 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1969  hypothetical protein  34.21 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  0.0475375 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1662  hypothetical protein  36.84 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293702  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5142  hypothetical protein  31.82 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  32.95 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1741  hypothetical protein  30.34 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3591  hypothetical protein  36.84 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1516  transcriptional regulator, ArsR family  27.84 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.599896 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3421  hypothetical protein  32.22 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  28.12 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0147  hypothetical protein  30.59 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3007  hypothetical protein  34.62 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0952791  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1221  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  47.8  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1362  hypothetical protein  30.43 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1979  hypothetical protein  34.33 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.219481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5175  hypothetical protein  30.26 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.937206  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3365  hypothetical protein  26.6 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.753512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0146  hypothetical protein  31.03 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3712  hypothetical protein  27.63 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0876  hypothetical protein  29.17 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.195647 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1750  transcriptional regulator, ArsR family  24.73 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4287  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 132 aa  42  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.132275  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2686  hypothetical protein  24.42 
 
 		 119 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.463238  normal  0.104568 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1152  hypothetical protein  28.05 
 
 		 89 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.314563 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0723  transcriptional regulator, ArsR family  28.41 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.532728  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1920  putative transcriptional regulator  27.84 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1053  hypothetical protein  31.58 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.256423  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0464  hypothetical protein  27.84 
 
 		 199 aa  41.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000221199 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5206  hypothetical protein  40 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3906  transcription regulator  30.11 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>