19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0441 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0441  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  229  1e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0442  regulatory protein ArsR  40.86 
 
 
112 aa  70.1  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0147  hypothetical protein  32.63 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0245  hypothetical protein  39.02 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.305068  normal  0.0996387 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1390  hypothetical protein  40 
 
 
118 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1306  hypothetical protein  35.63 
 
 
116 aa  55.1  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000189351 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2339  hypothetical protein  42.03 
 
 
117 aa  53.9  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0946  hypothetical protein  37.66 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81682  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0877  putative transcriptional regulator  34.57 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.199532 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0641  transcription regulator  34.48 
 
 
114 aa  47.4  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0146  hypothetical protein  34.52 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3278  transcriptional regulator, ArsR family  31.03 
 
 
114 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5142  hypothetical protein  29.9 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3421  hypothetical protein  28.89 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3365  hypothetical protein  31.11 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.753512  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 
150 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1516  transcriptional regulator, ArsR family  28.74 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.599896 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2555  hypothetical protein  34.62 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.981859  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  29.21 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>