33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0442 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0442  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 112 aa  225  2e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0441  hypothetical protein  40.86 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2610  hypothetical protein  30.53 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00563905  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0946  hypothetical protein  30.23 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81682  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3421  hypothetical protein  29.03 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1221  hypothetical protein  31.82 
 
 		 117 aa  52.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1306  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000189351 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1516  transcriptional regulator, ArsR family  26.6 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.599896 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  29.41 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5142  hypothetical protein  26.53 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0245  hypothetical protein  33.72 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.305068  normal  0.0996387 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0147  hypothetical protein  30.59 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3712  hypothetical protein  29.76 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  26.44 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1872  transcription regulator  26 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0352712 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4287  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.132275  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2339  hypothetical protein  30.86 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2555  hypothetical protein  34.44 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.981859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3906  transcription regulator  30.21 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0876  hypothetical protein  30.12 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.195647 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0723  transcriptional regulator, ArsR family  28.42 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.532728  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3278  transcriptional regulator, ArsR family  31.87 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1390  hypothetical protein  35.29 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0146  hypothetical protein  29.81 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0877  putative transcriptional regulator  31.87 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.199532 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0407  hypothetical protein  25 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1920  putative transcriptional regulator  25.26 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1969  hypothetical protein  32.43 
 
 		 131 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  0.0475375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  41.2  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1053  hypothetical protein  28.26 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.256423  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  38 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>