82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1561 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1561  regulatory protein ArsR  100 
 
 
100 aa  200  4e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.442352  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0433  regulatory protein, ArsR  75.26 
 
 
100 aa  159  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1101  ArsR family transcriptional regulator  69.39 
 
 
105 aa  155  2e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00196595  hitchhiker  0.000145009 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0836  regulatory protein, ArsR  33.7 
 
 
101 aa  64.7  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0888  regulatory protein ArsR  32.97 
 
 
93 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.844031  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1986  transcriptional regulator, TrmB  30.3 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3558  ArsR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
97 aa  53.9  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.406985 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3885  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
116 aa  53.9  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11439  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3509  regulatory protein, ArsR  32.98 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1488  regulatory protein ArsR  32.29 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.486972  normal  0.347049 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5889  transcriptional regulator, ArsR family  50.98 
 
 
307 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0229  regulatory protein, ArsR  33.73 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00808889 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1330  regulatory protein, ArsR  32.22 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3194  transcriptional regulator, ArsR family  28.26 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.847871  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2323  hypothetical protein  26.8 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0166968  normal  0.857189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1455  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566564  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
207 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  38.71 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0045  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
111 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  37.04 
 
 
168 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
117 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
220 aa  44.3  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 
124 aa  44.3  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1887  ArsR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  36.54 
 
 
120 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3245  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 
208 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
108 aa  42.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  32.86 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
228 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  28.74 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  38.33 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
221 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2973  putative transcriptional regulator  36.76 
 
 
207 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0013  regulatory protein ArsR  25.88 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  30.14 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  38.18 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
150 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20640  regulatory protein ArsR  32.81 
 
 
310 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  35.19 
 
 
108 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  30.68 
 
 
144 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  34.55 
 
 
219 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2718  regulatory protein, ArsR  31.75 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3009  ArsR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
207 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1691  transcriptional regulator, ArsR family  28.05 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  36.07 
 
 
472 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2026  transcriptional regulator, ArsR family  28.05 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.318848  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0327  regulatory protein ArsR  27.84 
 
 
165 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.395704  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  32.79 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  34.48 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0607  hypothetical protein  34.78 
 
 
205 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
115 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
119 aa  40.4  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  27.12 
 
 
226 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2946  ArsR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
207 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.958799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3024  ArsR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
207 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3257  ArsR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
207 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2711  regulatory protein ArsR  37.29 
 
 
306 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
234 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
151 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3255  transcriptional regulator, ArsR family  36.76 
 
 
207 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8127  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 
209 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_876  transcriptional regulator, ArsR family  38.6 
 
 
112 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  33.8 
 
 
146 aa  40  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3321  transcriptional regulator, ArsR family  29.47 
 
 
350 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  33.93 
 
 
118 aa  40  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>