98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0229 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0229  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 110 aa  215  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00808889 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1182  transcriptional regulator, ArsR family  47.89 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00795875  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5889  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20640  regulatory protein ArsR  30.68 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2711  regulatory protein ArsR  30.95 
 
 		 306 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1561  regulatory protein ArsR  33.73 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.442352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6802  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 307 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  36.84 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  36.84 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 228 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1755  transcriptional regulator CzrA  40.35 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.952937  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  31.52 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 349 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 342 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0693  regulatory protein, ArsR  44.78 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273557 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 354 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1141  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1168  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  35.21 
 
 		 328 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  38.71 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1158  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 222 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2780  putative transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 227 aa  44.3  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  29.76 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 339 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 128 aa  44.3  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  32.14 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  30.68 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  39.62 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  34.48 
 
 		 223 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  32.43 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  36.76 
 
 		 122 aa  42.7  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  36.51 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1936  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 221 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5584  transcriptional regulator, TrmB  31.91 
 
 		 307 aa  42.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.107073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 337 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  28.71 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  34.43 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  33.77 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  40.35 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  36.51 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  36.21 
 
 		 93 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 102 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 327 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2803  ArsR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 216 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  31.87 
 
 		 131 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 226 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  31.75 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0433  regulatory protein, ArsR  28.74 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  37.74 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2878  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0946  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  37.74 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 226 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0485  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  35.94 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3558  ArsR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.406985 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  26.74 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 437 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  24 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  29.63 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2895  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 322 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0512058  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1691  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2026  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.318848  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  30.26 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  26.67 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  30.26 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  29.89 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.68 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1266  regulatory protein, ArsR  35.94 
 
 		 198 aa  40.4  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 118 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 118 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  39.22 
 
 		 113 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>