More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2439 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 108 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 118 aa  117  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 120 aa  110  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  51.58 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 118 aa  103  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 106 aa  96.7  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  51.58 
 
 		 106 aa  95.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 138 aa  88.2  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 92 aa  72  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  47.76 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  46.05 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 		 102 aa  67  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2592  regulatory protein ArsR  43.37 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.108396 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  43.37 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  43.37 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  39.39 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 115 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  44.19 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 110 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  43.24 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2313  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  44.58 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 114 aa  62  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  41.33 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  41.33 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  42.25 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  38.46 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  38.2 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4688  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000941473  hitchhiker  1.78464e-24 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  32.99 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0649  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  32.99 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 129 aa  60.1  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 101 aa  60.1  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 		 118 aa  60.1  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  40.24 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  48.57 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  43.66 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  42.25 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  31.18 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  35.63 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  41.86 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  34.12 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2699  transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0160  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  39.53 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 227 aa  57.8  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  38.04 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  39.19 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  47.14 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  36.47 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>