249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0803 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0803  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
181 aa  363  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0946  ArsR family transcriptional regulator  55.21 
 
 
171 aa  180  8.000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
122 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
117 aa  55.5  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  32.18 
 
 
118 aa  54.7  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
114 aa  54.7  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  32.5 
 
 
121 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  31.76 
 
 
118 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.05 
 
 
116 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
118 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
124 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  30.38 
 
 
123 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3252  regulatory protein ArsR  32.91 
 
 
110 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  30.38 
 
 
111 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  31.76 
 
 
118 aa  52  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
121 aa  52  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3553  regulatory protein, ArsR  32.91 
 
 
110 aa  52  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  31.76 
 
 
118 aa  52  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
118 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.46 
 
 
128 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5402  ArsR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
131 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5459  ArsR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
131 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
86 aa  51.6  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
341 aa  50.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  28.21 
 
 
114 aa  50.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
122 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  32.43 
 
 
120 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  29.11 
 
 
113 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
323 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  39.66 
 
 
341 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0190  ArsR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
121 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
111 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  26.74 
 
 
111 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
121 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
121 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  30.12 
 
 
112 aa  49.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  30.12 
 
 
112 aa  49.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  29.85 
 
 
111 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
131 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  28.21 
 
 
144 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
110 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  28.75 
 
 
119 aa  48.9  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  34.18 
 
 
123 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  38.33 
 
 
103 aa  48.5  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
341 aa  48.5  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 
132 aa  48.5  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
103 aa  48.5  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  30.21 
 
 
113 aa  48.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  38.33 
 
 
110 aa  47.8  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2780  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.67 
 
 
116 aa  47.8  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258272  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  30.23 
 
 
107 aa  47.8  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
104 aa  47.8  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
337 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  39.66 
 
 
328 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0485  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.21 
 
 
124 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
339 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 
324 aa  47.8  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  38.6 
 
 
342 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
169 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  35.48 
 
 
113 aa  46.6  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  38.6 
 
 
349 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  30.14 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  29.85 
 
 
330 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  31.17 
 
 
117 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 
121 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  37.31 
 
 
142 aa  45.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  30.3 
 
 
119 aa  45.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 
124 aa  45.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0985  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
267 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326764  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
146 aa  46.2  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  32.79 
 
 
121 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
112 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  31.25 
 
 
107 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
115 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 
120 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  38.6 
 
 
354 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1865  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
105 aa  45.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  29.73 
 
 
118 aa  45.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2860  ArsR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
115 aa  45.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  25.85 
 
 
222 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  33.73 
 
 
98 aa  45.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0693  regulatory protein, ArsR  27.71 
 
 
110 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0273557 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  29.07 
 
 
107 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  26.97 
 
 
110 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  40.74 
 
 
349 aa  45.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  22.43 
 
 
113 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1141  ArsR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
110 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
113 aa  45.1  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2281  transcriptional regulator, ArsR family  30.67 
 
 
122 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
115 aa  45.1  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
104 aa  45.4  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1158  ArsR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
110 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1168  ArsR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
110 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 
115 aa  45.1  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12071  ArsR-type repressor protein  27.16 
 
 
156 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  25.36 
 
 
223 aa  45.1  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
327 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
317 aa  44.7  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  31.52 
 
 
110 aa  44.7  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.07 
 
 
93 aa  44.7  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>