284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3539 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3539  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 228 aa  447  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3428  transcriptional regulator, MarR family  82.46 
 
 		 228 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5378  transcriptional regulator, ArsR family  75.35 
 
 		 215 aa  317  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2810  transcriptional regulator, ArsR family  63.96 
 
 		 229 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5093  protein tyrosine phosphatase  55.41 
 
 		 225 aa  225  6e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0105  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.34 
 
 		 226 aa  221  9e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4903  ArsR family transcriptional regulator  50.9 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4520  ArsR family transcriptional regulator  50.9 
 
 		 224 aa  208  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4607  ArsR family transcriptional regulator  50.9 
 
 		 224 aa  208  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1660  protein tyrosine phosphatase  51.35 
 
 		 225 aa  204  9e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0913425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3344  transcriptional regulator, MarR family  53.02 
 
 		 218 aa  201  9e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.670275  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 255 aa  94.7  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2803  ArsR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 269 aa  94.4  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  34.78 
 
 		 254 aa  85.1  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  30.56 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  32.43 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  32.11 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  31.39 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35100  arsenate reductase  33.85 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  37.68 
 
 		 162 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  29.92 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2962  arsenate reductase  34.51 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.11 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.261916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1928  arsenate reductase  30.77 
 
 		 162 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245596  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  35.29 
 
 		 165 aa  61.6  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  35.04 
 
 		 165 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0533  arsenate reductase, putative  33.58 
 
 		 171 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3666  protein tyrosine phosphatase  32.79 
 
 		 160 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2860  arsenate reductase  31.34 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.796184  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2481  protein tyrosine phosphatase  31.34 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.52 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  31.01 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1594  protein tyrosine phosphatase  34.88 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  34.78 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0819  radical SAM family protein  32.23 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.29 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.21 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  32.84 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  35.09 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  29.85 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2398  protein tyrosine phosphatase  31.78 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798695 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.78 
 
 		 164 aa  57  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  32.86 
 
 		 165 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.9 
 
 		 138 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  29.85 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.54 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.68 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  25.32 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  33.06 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1579  protein tyrosine phosphatase  31.72 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3079  protein tyrosine phosphatase  29.49 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0583142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  31.82 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  34.78 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.46 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  33.61 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  30.37 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  30.51 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  29.23 
 
 		 138 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  28.36 
 
 		 164 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  35.29 
 
 		 142 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  30.43 
 
 		 174 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  33.62 
 
 		 164 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  41.11 
 
 		 129 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 116 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2141  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.95 
 
 		 159 aa  54.3  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0666  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  33.64 
 
 		 133 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1219  protein tyrosine phosphatase  28.57 
 
 		 138 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1980  protein tyrosine phosphatase  34.75 
 
 		 163 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221335  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  34.78 
 
 		 164 aa  53.9  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.08 
 
 		 299 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2716  arsenate reductase  31.86 
 
 		 156 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  28.7 
 
 		 150 aa  53.1  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.17 
 
 		 152 aa  52.8  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  35.9 
 
 		 139 aa  52.8  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1787  protein tyrosine phosphatase  31.11 
 
 		 179 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3036  protein tyrosine phosphatase  31.86 
 
 		 156 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  31.82 
 
 		 142 aa  52.8  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  29.77 
 
 		 169 aa  52.4  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  28.57 
 
 		 94 aa  52.4  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2334  protein tyrosine phosphatase  30.26 
 
 		 168 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.645667  normal  0.0775435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  32.58 
 
 		 171 aa  52.4  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3819  protein tyrosine phosphatase  30.26 
 
 		 168 aa  52.4  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0355  protein tyrosine phosphatase  26.23 
 
 		 137 aa  52.4  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.62 
 
 		 164 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  30.23 
 
 		 142 aa  51.6  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2878  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 112 aa  51.6  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1502  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.37 
 
 		 156 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.240975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  30.3 
 
 		 134 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  30.88 
 
 		 164 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  28.95 
 
 		 145 aa  50.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 149 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  33.85 
 
 		 151 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  30.48 
 
 		 142 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5673  protein tyrosine phosphatase  30.77 
 
 		 164 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>