More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0105 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0105  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  100 
 
 		 226 aa  439  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3428  transcriptional regulator, MarR family  56.76 
 
 		 228 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3539  transcriptional regulator, ArsR family  57.34 
 
 		 228 aa  221  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5093  protein tyrosine phosphatase  56.22 
 
 		 225 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2810  transcriptional regulator, ArsR family  58.64 
 
 		 229 aa  211  7.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5378  transcriptional regulator, ArsR family  55.81 
 
 		 215 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4903  ArsR family transcriptional regulator  53.88 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4520  ArsR family transcriptional regulator  53.88 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4607  ArsR family transcriptional regulator  53.88 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1660  protein tyrosine phosphatase  51.61 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0913425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3344  transcriptional regulator, MarR family  52.21 
 
 		 218 aa  188  7e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.670275  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 270 aa  95.9  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  35.8 
 
 		 270 aa  95.9  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  37.33 
 
 		 254 aa  92  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  32.79 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2803  ArsR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 269 aa  89.7  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 291 aa  78.6  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  31.39 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3666  protein tyrosine phosphatase  37.6 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.12 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.34 
 
 		 144 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  39.66 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  31.33 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2481  protein tyrosine phosphatase  33.61 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2860  arsenate reductase  33.61 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.796184  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.87 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  32.33 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  36.23 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  38.79 
 
 		 158 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  34.59 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  33.07 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  34.59 
 
 		 165 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.09 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.261916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  27.8 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.58 
 
 		 136 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1641  protein tyrosine phosphatase  28.23 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  33.59 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.59 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  34.06 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.78 
 
 		 167 aa  62  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117198 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1980  protein tyrosine phosphatase  38.52 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221335  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.06 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3826  protein tyrosine phosphatase  34.78 
 
 		 167 aa  62  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.248837 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  32.58 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.84 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  31.34 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.03 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  33.86 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  33.86 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  33.86 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  37.72 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  34.59 
 
 		 150 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  33.83 
 
 		 142 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  36.72 
 
 		 164 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  32.85 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6165  protein tyrosine phosphatase  36.84 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.237527 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  35.34 
 
 		 142 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  26.79 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  35.19 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1579  protein tyrosine phosphatase  33.82 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.6 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00628  arsenate reductase  33.1 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.102158  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  33.87 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0819  radical SAM family protein  34.15 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  36.52 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  34.11 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0533  arsenate reductase, putative  31.3 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.64 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1787  protein tyrosine phosphatase  32.14 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.13 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5673  protein tyrosine phosphatase  34.78 
 
 		 164 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5707  protein tyrosine phosphatase  34.56 
 
 		 164 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3821  protein tyrosine phosphatase  28.35 
 
 		 138 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  35.34 
 
 		 139 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.96 
 
 		 164 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.65 
 
 		 139 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  36.7 
 
 		 136 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  32.33 
 
 		 142 aa  58.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.62 
 
 		 136 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2336  protein tyrosine phosphatase  28.35 
 
 		 138 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0739912 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1659  protein tyrosine phosphatase  35.11 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  35.45 
 
 		 164 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3819  protein tyrosine phosphatase  30.66 
 
 		 168 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0456  arsenate reductase  33.57 
 
 		 164 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1942  arsenate reductase ArsC  33.57 
 
 		 164 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2141  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32 
 
 		 159 aa  57  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2037  arsenate reductase ArsC  33.57 
 
 		 164 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  39.2 
 
 		 144 aa  57  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  35.66 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  31.82 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>