More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4607 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4520  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
224 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4607  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
224 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4903  ArsR family transcriptional regulator  99.55 
 
 
224 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5093  protein tyrosine phosphatase  65.75 
 
 
225 aa  287  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1660  protein tyrosine phosphatase  64.11 
 
 
225 aa  267  8e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0913425  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3428  transcriptional regulator, MarR family  53.6 
 
 
228 aa  224  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3539  transcriptional regulator, ArsR family  50.9 
 
 
228 aa  208  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0105  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.88 
 
 
226 aa  206  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3344  transcriptional regulator, MarR family  51.39 
 
 
218 aa  201  7e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.670275  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5378  transcriptional regulator, ArsR family  50.98 
 
 
215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2810  transcriptional regulator, ArsR family  53.15 
 
 
229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723176  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
255 aa  101  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  35.65 
 
 
254 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  35.47 
 
 
258 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2803  ArsR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
269 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  33.47 
 
 
258 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  35.96 
 
 
254 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  39.16 
 
 
165 aa  88.2  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
257 aa  86.3  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.76 
 
 
165 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
270 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  37.76 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  38.35 
 
 
158 aa  79  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  37.59 
 
 
158 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.04 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.261916  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  31.82 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.04 
 
 
164 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 
164 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 
162 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.71 
 
 
164 aa  73.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  37.86 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  29.78 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.76 
 
 
175 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  33.07 
 
 
248 aa  72  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.75 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5056  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
175 aa  71.6  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  34.75 
 
 
164 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3666  protein tyrosine phosphatase  34.59 
 
 
160 aa  71.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0325  protein tyrosine phosphatase  36.03 
 
 
175 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  36.8 
 
 
164 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  29.85 
 
 
141 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  29.53 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1980  protein tyrosine phosphatase  35.04 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221335  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0585  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.28 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  33.58 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.09 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0618  protein tyrosine phosphatase  35.29 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  33.57 
 
 
165 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00628  arsenate reductase  33.58 
 
 
176 aa  67.8  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.102158  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6165  protein tyrosine phosphatase  37.04 
 
 
164 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.237527 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  31.72 
 
 
174 aa  67.8  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 
150 aa  67  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  29.06 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  34.27 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  28.68 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  32.82 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2141  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.83 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3200  protein tyrosine phosphatase  32.85 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  27.59 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.09 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5707  protein tyrosine phosphatase  35.09 
 
 
164 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  32.59 
 
 
175 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
142 aa  64.3  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.57 
 
 
143 aa  64.3  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  35.09 
 
 
164 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  31.75 
 
 
134 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  38.4 
 
 
139 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  31.85 
 
 
156 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  31.75 
 
 
134 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  31.75 
 
 
134 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2481  protein tyrosine phosphatase  32.58 
 
 
163 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
144 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  33.58 
 
 
145 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0875  protein tyrosine phosphatase  33.56 
 
 
189 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  32.35 
 
 
170 aa  63.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2860  arsenate reductase  32.58 
 
 
163 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.796184  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  34.56 
 
 
175 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  33.82 
 
 
317 aa  63.2  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  31.75 
 
 
134 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  31.75 
 
 
134 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  32.54 
 
 
134 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.31 
 
 
175 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  31.75 
 
 
134 aa  62.4  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4073  protein tyrosine phosphatase  33.58 
 
 
175 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713797  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25910  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.33 
 
 
156 aa  62.4  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  34.86 
 
 
148 aa  62.4  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2898  arsenate reductase  30.95 
 
 
134 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.871154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13220  protein-tyrosine-phosphatase  34.38 
 
 
142 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211639  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  35.24 
 
 
142 aa  62  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  32.59 
 
 
169 aa  61.6  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  31.75 
 
 
134 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3124  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.12 
 
 
180 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.641523  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3196  arsenate reductase  31.75 
 
 
134 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9959  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  40.3 
 
 
151 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5600  protein tyrosine phosphatase  33.59 
 
 
164 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123028  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3255  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  28.48 
 
 
172 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1787  protein tyrosine phosphatase  31.43 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00981569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>