More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5378 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5378  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 215 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3428  transcriptional regulator, MarR family  77.67 
 
 		 228 aa  331  5e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3539  transcriptional regulator, ArsR family  75.35 
 
 		 228 aa  317  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2810  transcriptional regulator, ArsR family  67.31 
 
 		 229 aa  254  8e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3344  transcriptional regulator, MarR family  58.33 
 
 		 218 aa  220  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.670275  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5093  protein tyrosine phosphatase  54.5 
 
 		 225 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0105  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  55.81 
 
 		 226 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4903  ArsR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 224 aa  201  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4520  ArsR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4607  ArsR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1660  protein tyrosine phosphatase  50.71 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0913425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2803  ArsR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 269 aa  102  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 255 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  34.05 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 270 aa  85.9  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  31.73 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  31.17 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  31.21 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  30 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0819  radical SAM family protein  33.6 
 
 		 125 aa  67.8  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.88 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.45 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35100  arsenate reductase  37.21 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  29.6 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  38.28 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.9 
 
 		 140 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2962  arsenate reductase  36.44 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.71 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.5 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0533  arsenate reductase, putative  31.01 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8607  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.9 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.40475 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  39.62 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  29.63 
 
 		 138 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  31.85 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1112  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.26 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.988044  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  34.31 
 
 		 165 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1219  protein tyrosine phosphatase  28.47 
 
 		 138 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0314  arsenate reductase  31.97 
 
 		 132 aa  57  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 142 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  32.33 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0588  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.51 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176284 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.29 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3466  protein tyrosine phosphatase  31.91 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  32.59 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  32.31 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.46 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2860  arsenate reductase  30.6 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.796184  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2481  protein tyrosine phosphatase  30.6 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  30.82 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1579  protein tyrosine phosphatase  29.66 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1554  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.78 
 
 		 138 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3666  protein tyrosine phosphatase  30 
 
 		 160 aa  54.7  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 284 aa  54.7  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  26.47 
 
 		 137 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  32.86 
 
 		 165 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  31.88 
 
 		 158 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1928  arsenate reductase  27.41 
 
 		 162 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245596  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  33.57 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  31.54 
 
 		 151 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.13 
 
 		 165 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0585  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32 
 
 		 177 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  33.02 
 
 		 157 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0355  protein tyrosine phosphatase  24.8 
 
 		 137 aa  53.9  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  25 
 
 		 133 aa  53.9  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3821  protein tyrosine phosphatase  29.03 
 
 		 138 aa  53.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  33.65 
 
 		 150 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.87 
 
 		 164 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  30 
 
 		 174 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  33.83 
 
 		 498 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  28.36 
 
 		 148 aa  53.5  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2336  protein tyrosine phosphatase  29.03 
 
 		 138 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0739912 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  31.69 
 
 		 164 aa  53.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  31.65 
 
 		 248 aa  52.8  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3552  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.56 
 
 		 305 aa  52.8  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  30 
 
 		 142 aa  52.8  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  32.58 
 
 		 136 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0826  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  33.33 
 
 		 154 aa  52.4  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.24 
 
 		 136 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  39.25 
 
 		 144 aa  52.4  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  47.17 
 
 		 305 aa  52.4  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  26.61 
 
 		 298 aa  52  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1980  protein tyrosine phosphatase  33.62 
 
 		 163 aa  52.4  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221335  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3819  protein tyrosine phosphatase  29.17 
 
 		 168 aa  52  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2334  protein tyrosine phosphatase  29.17 
 
 		 168 aa  52  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.645667  normal  0.0775435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  30.3 
 
 		 156 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  29.27 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  47.17 
 
 		 305 aa  51.6  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.58 
 
 		 139 aa  51.6  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.76 
 
 		 175 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  33.8 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  28.57 
 
 		 150 aa  51.6  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  30.77 
 
 		 145 aa  51.2  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  30.77 
 
 		 148 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  32.67 
 
 		 135 aa  51.6  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.61 
 
 		 453 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  29.86 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>