More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1928 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1928  arsenate reductase  100 
 
 		 162 aa  331  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245596  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2398  protein tyrosine phosphatase  67.95 
 
 		 156 aa  226  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798695 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3079  protein tyrosine phosphatase  66.03 
 
 		 156 aa  221  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0583142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3036  protein tyrosine phosphatase  64.74 
 
 		 156 aa  220  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2716  arsenate reductase  64.74 
 
 		 156 aa  220  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35100  arsenate reductase  66.03 
 
 		 156 aa  218  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2962  arsenate reductase  65.38 
 
 		 156 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1502  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  59.62 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.240975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  60.26 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25910  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  55.13 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2141  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  55.06 
 
 		 159 aa  177  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  51.27 
 
 		 174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 284 aa  170  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3666  protein tyrosine phosphatase  51.27 
 
 		 160 aa  163  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  51.27 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  50.63 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2481  protein tyrosine phosphatase  46.84 
 
 		 163 aa  153  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2860  arsenate reductase  46.84 
 
 		 163 aa  153  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.796184  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3780  protein tyrosine phosphatase  44.44 
 
 		 167 aa  141  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0223758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  46.5 
 
 		 177 aa  140  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.1 
 
 		 175 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99461  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5722  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.1 
 
 		 175 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  44.94 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  46.79 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3579  protein tyrosine phosphatase  46.84 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.747703 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.23 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5346  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.57 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.524005 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  44.23 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  43.31 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3255  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.57 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.81 
 
 		 168 aa  131  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.261916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  41.72 
 
 		 165 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2415  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.42 
 
 		 176 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.214614 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  43.75 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2588  protein tyrosine phosphatase  46.41 
 
 		 167 aa  130  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.570758  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  47.37 
 
 		 166 aa  130  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3119  protein tyrosine phosphatase  43.83 
 
 		 168 aa  130  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1787  protein tyrosine phosphatase  41.88 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981569 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00628  arsenate reductase  42.68 
 
 		 176 aa  128  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.102158  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.33 
 
 		 165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.57 
 
 		 175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4215  protein tyrosine phosphatase  43.04 
 
 		 164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  44.44 
 
 		 179 aa  127  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3200  protein tyrosine phosphatase  42.77 
 
 		 182 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5600  protein tyrosine phosphatase  43.04 
 
 		 164 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  41.98 
 
 		 164 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.61 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117198 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0533  arsenate reductase, putative  47.76 
 
 		 171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0207  protein tyrosine phosphatase  42.94 
 
 		 173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.538928 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.86 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3826  protein tyrosine phosphatase  41.61 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.248837 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  43.04 
 
 		 317 aa  126  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  41.1 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  43.12 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4381  protein tyrosine phosphatase  44.87 
 
 		 171 aa  125  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5056  protein tyrosine phosphatase  42.59 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1820  protein tyrosine phosphatase  43.04 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.102898 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3466  protein tyrosine phosphatase  43.31 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4965  protein tyrosine phosphatase  43.31 
 
 		 172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219963  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0875  protein tyrosine phosphatase  41.61 
 
 		 189 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3195  protein tyrosine phosphatase  43.31 
 
 		 172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  42.21 
 
 		 162 aa  124  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6164  protein tyrosine phosphatase  41.77 
 
 		 164 aa  124  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.398136 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  42.21 
 
 		 164 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03334  arsenate reductase  49.61 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1128  putative arsenate reductase (arsenical PUMP modifier) protein  43.04 
 
 		 164 aa  123  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  41.14 
 
 		 298 aa  123  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.12 
 
 		 175 aa  123  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4073  protein tyrosine phosphatase  42.41 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713797  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  41.25 
 
 		 295 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6329  protein tyrosine phosphatase  41.77 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720558  normal  0.0816451 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5708  protein tyrosine phosphatase  41.77 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5377  protein tyrosine phosphatase  41.94 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  40.74 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0216  protein tyrosine phosphatase  42.5 
 
 		 178 aa  122  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5707  protein tyrosine phosphatase  42.31 
 
 		 164 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3819  protein tyrosine phosphatase  41.1 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0618  protein tyrosine phosphatase  42.41 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0653  protein tyrosine phosphatase  43.75 
 
 		 168 aa  121  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.448039  normal  0.447799 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2334  protein tyrosine phosphatase  41.1 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.645667  normal  0.0775435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  42.41 
 
 		 171 aa  121  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.59 
 
 		 164 aa  120  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 291 aa  120  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1344  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.74 
 
 		 165 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.230877  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2516  protein tyrosine phosphatase  44.74 
 
 		 165 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3124  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.14 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.641523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6562  protein tyrosine phosphatase  40.51 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0959  arsenate reductase  40.51 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3419  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.41 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5673  protein tyrosine phosphatase  40.51 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0325  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 175 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0558  arsenate reductase  39.24 
 
 		 164 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0569825  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0913  arsenate reductase  39.24 
 
 		 164 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.910789  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1882  arsenate reductase  39.24 
 
 		 164 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2037  arsenate reductase ArsC  39.24 
 
 		 164 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0456  arsenate reductase  39.24 
 
 		 164 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1942  arsenate reductase ArsC  39.24 
 
 		 164 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1140  protein tyrosine phosphatase  41.28 
 
 		 176 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.647327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 287 aa  116  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1980  protein tyrosine phosphatase  40.36 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221335  normal  0.141438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>