267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1140 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1140  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 176 aa  365  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.647327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  51.2 
 
 		 174 aa  160  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3780  protein tyrosine phosphatase  48.52 
 
 		 167 aa  154  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0223758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0533  arsenate reductase, putative  48.8 
 
 		 171 aa  142  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2334  protein tyrosine phosphatase  49.67 
 
 		 168 aa  131  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.645667  normal  0.0775435 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3819  protein tyrosine phosphatase  49.67 
 
 		 168 aa  131  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35100  arsenate reductase  42.17 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03334  arsenate reductase  45.8 
 
 		 128 aa  120  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2716  arsenate reductase  42.77 
 
 		 156 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2962  arsenate reductase  40.96 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2398  protein tyrosine phosphatase  42.17 
 
 		 156 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3036  protein tyrosine phosphatase  42.17 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1928  arsenate reductase  41.28 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245596  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25910  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.78 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00628  arsenate reductase  37.35 
 
 		 176 aa  111  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.102158  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1344  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.75 
 
 		 165 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.230877  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2516  protein tyrosine phosphatase  39.75 
 
 		 165 aa  110  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 284 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4215  protein tyrosine phosphatase  38.15 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2141  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.01 
 
 		 159 aa  108  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3079  protein tyrosine phosphatase  39.76 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0583142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  35.06 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3579  protein tyrosine phosphatase  39.77 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.747703 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5765  protein tyrosine phosphatase  39.16 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5346  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.05 
 
 		 164 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.524005 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4381  protein tyrosine phosphatase  36.31 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  37.58 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  35.53 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  35.06 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6562  protein tyrosine phosphatase  37.06 
 
 		 168 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5600  protein tyrosine phosphatase  36.81 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2588  protein tyrosine phosphatase  38.82 
 
 		 167 aa  101  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.570758  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6164  protein tyrosine phosphatase  37.65 
 
 		 164 aa  101  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.398136 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  34.13 
 
 		 165 aa  100  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3255  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.6 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  36.65 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5673  protein tyrosine phosphatase  36.47 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6329  protein tyrosine phosphatase  34.5 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720558  normal  0.0816451 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2481  protein tyrosine phosphatase  35.9 
 
 		 163 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5708  protein tyrosine phosphatase  37.06 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1820  protein tyrosine phosphatase  38.51 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.102898 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3826  protein tyrosine phosphatase  39.33 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.248837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.33 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2860  arsenate reductase  35.9 
 
 		 163 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.796184  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4965  protein tyrosine phosphatase  43.09 
 
 		 172 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219963  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3195  protein tyrosine phosphatase  43.09 
 
 		 172 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1502  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.34 
 
 		 156 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.240975  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1128  putative arsenate reductase (arsenical PUMP modifier) protein  38.18 
 
 		 164 aa  97.8  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0959  arsenate reductase  36.47 
 
 		 164 aa  97.8  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.43 
 
 		 175 aa  97.8  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2415  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.19 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.214614 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  32.93 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1787  protein tyrosine phosphatase  34.78 
 
 		 179 aa  95.1  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981569 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5056  protein tyrosine phosphatase  36.84 
 
 		 175 aa  95.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1882  arsenate reductase  36.47 
 
 		 164 aa  95.1  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0558  arsenate reductase  36.47 
 
 		 164 aa  95.1  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0569825  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3666  protein tyrosine phosphatase  36.3 
 
 		 160 aa  94.7  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  34.68 
 
 		 164 aa  94.7  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0913  arsenate reductase  36.47 
 
 		 164 aa  95.1  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.910789  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0456  arsenate reductase  36.47 
 
 		 164 aa  94.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1942  arsenate reductase ArsC  36.47 
 
 		 164 aa  94.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2037  arsenate reductase ArsC  36.47 
 
 		 164 aa  94.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  33.73 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3200  protein tyrosine phosphatase  33.12 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.5 
 
 		 175 aa  94  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0216  protein tyrosine phosphatase  32.22 
 
 		 178 aa  93.6  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1579  protein tyrosine phosphatase  31.74 
 
 		 159 aa  93.2  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3119  protein tyrosine phosphatase  34.32 
 
 		 168 aa  92.8  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1980  protein tyrosine phosphatase  30.23 
 
 		 163 aa  93.2  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221335  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  31.79 
 
 		 317 aa  93.2  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  35.77 
 
 		 298 aa  92.4  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  33.13 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0653  protein tyrosine phosphatase  37.58 
 
 		 168 aa  92  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.448039  normal  0.447799 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  35.5 
 
 		 175 aa  92  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  33.91 
 
 		 162 aa  91.3  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0875  protein tyrosine phosphatase  32.78 
 
 		 189 aa  90.9  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  31.14 
 
 		 164 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  35.66 
 
 		 165 aa  90.1  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  36.55 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0585  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.12 
 
 		 177 aa  89  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3466  protein tyrosine phosphatase  38 
 
 		 168 aa  89.4  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  32.34 
 
 		 171 aa  89  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 317 aa  88.6  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5377  protein tyrosine phosphatase  31.74 
 
 		 173 aa  88.2  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.14 
 
 		 164 aa  88.6  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5707  protein tyrosine phosphatase  31.18 
 
 		 164 aa  88.2  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  36.55 
 
 		 165 aa  88.2  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 175 aa  87.8  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2337  protein tyrosine phosphatase  35.54 
 
 		 167 aa  87.8  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.441606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3124  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30 
 
 		 180 aa  87.8  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.641523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  33.56 
 
 		 170 aa  87.8  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4073  protein tyrosine phosphatase  30.05 
 
 		 175 aa  87.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713797  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0618  protein tyrosine phosphatase  33.1 
 
 		 175 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.93 
 
 		 165 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 291 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6165  protein tyrosine phosphatase  37.4 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.237527 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  32.65 
 
 		 169 aa  86.7  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0325  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 		 175 aa  85.9  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3419  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  29.82 
 
 		 175 aa  85.1  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>