More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0533 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0533  arsenate reductase, putative  100 
 
 		 171 aa  349  8.999999999999999e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3819  protein tyrosine phosphatase  57.14 
 
 		 168 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2334  protein tyrosine phosphatase  57.14 
 
 		 168 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.645667  normal  0.0775435 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  53.15 
 
 		 174 aa  160  9e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3780  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 167 aa  147  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0223758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1140  protein tyrosine phosphatase  48.8 
 
 		 176 aa  142  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.647327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  49.29 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  46.54 
 
 		 284 aa  130  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  48.59 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2141  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.4 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  46.15 
 
 		 317 aa  127  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35100  arsenate reductase  50.36 
 
 		 156 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2415  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.56 
 
 		 176 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.214614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1928  arsenate reductase  47.76 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245596  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3666  protein tyrosine phosphatase  46.84 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  51.49 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2962  arsenate reductase  50 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0216  protein tyrosine phosphatase  43.95 
 
 		 178 aa  124  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2398  protein tyrosine phosphatase  49.26 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798695 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.4 
 
 		 175 aa  123  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2716  arsenate reductase  49.26 
 
 		 156 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2860  arsenate reductase  44.23 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.796184  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2481  protein tyrosine phosphatase  44.23 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3036  protein tyrosine phosphatase  49.26 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0618  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 		 175 aa  121  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  45.27 
 
 		 177 aa  120  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  43.31 
 
 		 179 aa  120  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00628  arsenate reductase  42.68 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.102158  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3124  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.87 
 
 		 180 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.641523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4073  protein tyrosine phosphatase  44.59 
 
 		 175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713797  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3079  protein tyrosine phosphatase  47.79 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0583142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3826  protein tyrosine phosphatase  52.25 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.248837 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  53.21 
 
 		 298 aa  117  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52.25 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.77 
 
 		 175 aa  117  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  46.38 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1344  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.9 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.230877  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1787  protein tyrosine phosphatase  43.8 
 
 		 179 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981569 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2516  protein tyrosine phosphatase  43.9 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  44.44 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03334  arsenate reductase  47.06 
 
 		 128 aa  115  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3419  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.65 
 
 		 175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  42.04 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  44.06 
 
 		 165 aa  114  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5056  protein tyrosine phosphatase  41.77 
 
 		 175 aa  114  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2540  protein tyrosine phosphatase  43.54 
 
 		 179 aa  114  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.232269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  43.45 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0875  protein tyrosine phosphatase  42.77 
 
 		 189 aa  114  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  40.51 
 
 		 164 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 317 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.36 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25910  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.16 
 
 		 156 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  41.46 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  41.4 
 
 		 175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0207  protein tyrosine phosphatase  44.37 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.538928 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 291 aa  112  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  46.15 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3200  protein tyrosine phosphatase  42.75 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.04 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5722  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.04 
 
 		 175 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.04 
 
 		 175 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4381  protein tyrosine phosphatase  43.84 
 
 		 171 aa  110  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.96 
 
 		 168 aa  110  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.261916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3466  protein tyrosine phosphatase  43.95 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3255  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.45 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  42.66 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  42.18 
 
 		 169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0325  protein tyrosine phosphatase  45.32 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3579  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.747703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1502  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.85 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.240975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4965  protein tyrosine phosphatase  41.28 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219963  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0653  protein tyrosine phosphatase  44.53 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.448039  normal  0.447799 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3195  protein tyrosine phosphatase  41.28 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2588  protein tyrosine phosphatase  45.71 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.570758  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6329  protein tyrosine phosphatase  49.55 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720558  normal  0.0816451 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6164  protein tyrosine phosphatase  42.58 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.398136 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5673  protein tyrosine phosphatase  42.95 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  40.69 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  44.53 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1128  putative arsenate reductase (arsenical PUMP modifier) protein  42.21 
 
 		 164 aa  108  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4215  protein tyrosine phosphatase  41.77 
 
 		 164 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.96 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.26 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5346  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.55 
 
 		 164 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.524005 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5600  protein tyrosine phosphatase  48.65 
 
 		 164 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1579  protein tyrosine phosphatase  43.48 
 
 		 159 aa  107  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1980  protein tyrosine phosphatase  41.73 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221335  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0959  arsenate reductase  49.55 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6562  protein tyrosine phosphatase  48.65 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5765  protein tyrosine phosphatase  48.65 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5377  protein tyrosine phosphatase  42.07 
 
 		 173 aa  105  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0585  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.36 
 
 		 177 aa  105  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5707  protein tyrosine phosphatase  47.32 
 
 		 164 aa  105  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  39.58 
 
 		 145 aa  104  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3119  protein tyrosine phosphatase  41.92 
 
 		 168 aa  104  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  39.86 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  43.75 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0913  arsenate reductase  48.65 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.910789  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1942  arsenate reductase ArsC  48.65 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>