More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A1882 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0558  arsenate reductase  100 
 
 
164 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0569825  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1882  arsenate reductase  100 
 
 
164 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0913  arsenate reductase  100 
 
 
164 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.910789  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1942  arsenate reductase ArsC  99.39 
 
 
164 aa  336  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0456  arsenate reductase  99.39 
 
 
164 aa  336  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2037  arsenate reductase ArsC  99.39 
 
 
164 aa  336  9e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6164  protein tyrosine phosphatase  89.63 
 
 
164 aa  310  6.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.398136 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0959  arsenate reductase  89.63 
 
 
164 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6562  protein tyrosine phosphatase  88.41 
 
 
168 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4215  protein tyrosine phosphatase  87.73 
 
 
164 aa  299  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5708  protein tyrosine phosphatase  87.2 
 
 
164 aa  298  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5600  protein tyrosine phosphatase  85.37 
 
 
164 aa  297  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123028  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5673  protein tyrosine phosphatase  85.98 
 
 
164 aa  295  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4965  protein tyrosine phosphatase  84.15 
 
 
172 aa  294  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219963  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3195  protein tyrosine phosphatase  84.15 
 
 
172 aa  294  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6329  protein tyrosine phosphatase  84.15 
 
 
164 aa  292  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720558  normal  0.0816451 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3255  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  83.95 
 
 
172 aa  291  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5346  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  82.32 
 
 
164 aa  290  6e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.524005 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1820  protein tyrosine phosphatase  80.49 
 
 
164 aa  283  7e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.102898 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3579  protein tyrosine phosphatase  80.98 
 
 
164 aa  281  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.747703 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1128  putative arsenate reductase (arsenical PUMP modifier) protein  79.27 
 
 
164 aa  276  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  79.75 
 
 
167 aa  275  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117198 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3826  protein tyrosine phosphatase  79.75 
 
 
167 aa  275  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.248837 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5765  protein tyrosine phosphatase  79.27 
 
 
164 aa  261  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3119  protein tyrosine phosphatase  72.62 
 
 
168 aa  248  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  48.47 
 
 
164 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.85 
 
 
164 aa  158  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4381  protein tyrosine phosphatase  49.7 
 
 
171 aa  155  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  50.62 
 
 
166 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1344  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.8 
 
 
165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.230877  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2588  protein tyrosine phosphatase  49.07 
 
 
167 aa  150  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.570758  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  45.83 
 
 
165 aa  149  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2516  protein tyrosine phosphatase  48.19 
 
 
165 aa  149  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.3 
 
 
175 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  46.2 
 
 
165 aa  149  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5377  protein tyrosine phosphatase  47.17 
 
 
173 aa  147  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  47.56 
 
 
165 aa  147  7e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  47.2 
 
 
170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5056  protein tyrosine phosphatase  47.53 
 
 
175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3124  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.91 
 
 
180 aa  145  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.641523  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  46.34 
 
 
165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.34 
 
 
165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  45.62 
 
 
175 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  45.57 
 
 
164 aa  142  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.58 
 
 
168 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.261916  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.25 
 
 
175 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0207  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
173 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.538928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  45.96 
 
 
165 aa  141  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  46.84 
 
 
179 aa  141  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.2 
 
 
164 aa  140  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  45.73 
 
 
162 aa  140  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5707  protein tyrosine phosphatase  44.1 
 
 
164 aa  140  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  43.48 
 
 
164 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0325  protein tyrosine phosphatase  46.58 
 
 
175 aa  138  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.12 
 
 
164 aa  137  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00628  arsenate reductase  48.78 
 
 
176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.102158  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  43.83 
 
 
171 aa  137  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0618  protein tyrosine phosphatase  45.68 
 
 
175 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3200  protein tyrosine phosphatase  43.48 
 
 
182 aa  137  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0875  protein tyrosine phosphatase  46.25 
 
 
189 aa  137  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  45.96 
 
 
291 aa  137  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  45.12 
 
 
164 aa  135  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  44.72 
 
 
317 aa  136  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2415  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.67 
 
 
176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.214614 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  43.48 
 
 
169 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
276 aa  134  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0653  protein tyrosine phosphatase  49.29 
 
 
168 aa  133  8e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.448039  normal  0.447799 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1787  protein tyrosine phosphatase  43.9 
 
 
179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00981569 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6165  protein tyrosine phosphatase  44.44 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.237527 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3466  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.86 
 
 
175 aa  132  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99461  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5722  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.86 
 
 
175 aa  132  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  45.81 
 
 
270 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  46.41 
 
 
177 aa  132  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
298 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
270 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  45.57 
 
 
175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2540  protein tyrosine phosphatase  41.98 
 
 
179 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.232269  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1579  protein tyrosine phosphatase  44.59 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4073  protein tyrosine phosphatase  43.75 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713797  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0216  protein tyrosine phosphatase  44.1 
 
 
178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
317 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  44.72 
 
 
287 aa  127  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  43.67 
 
 
174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3419  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.3 
 
 
175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1980  protein tyrosine phosphatase  46.88 
 
 
163 aa  124  8.000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221335  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3780  protein tyrosine phosphatase  42.59 
 
 
167 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0223758  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2966  protein tyrosine phosphatase  36.02 
 
 
165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1928  arsenate reductase  39.24 
 
 
162 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245596  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1594  protein tyrosine phosphatase  46.51 
 
 
167 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  38.12 
 
 
295 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  41.14 
 
 
156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2337  protein tyrosine phosphatase  45.96 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.441606 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25910  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.77 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  44.9 
 
 
158 aa  111  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1502  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.24 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.240975  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35100  arsenate reductase  42.41 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772564  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2962  arsenate reductase  41.77 
 
 
156 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3036  protein tyrosine phosphatase  40.13 
 
 
156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294827  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  44.22 
 
 
158 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>