More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1660 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1660  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
225 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0913425  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5093  protein tyrosine phosphatase  76.89 
 
 
225 aa  345  4e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4520  ArsR family transcriptional regulator  64.11 
 
 
224 aa  267  8e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4607  ArsR family transcriptional regulator  64.11 
 
 
224 aa  267  8e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4903  ArsR family transcriptional regulator  63.68 
 
 
224 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3428  transcriptional regulator, MarR family  54.42 
 
 
228 aa  215  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3344  transcriptional regulator, MarR family  57.49 
 
 
218 aa  214  8e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.670275  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3539  transcriptional regulator, ArsR family  51.35 
 
 
228 aa  204  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0105  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.61 
 
 
226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2810  transcriptional regulator, ArsR family  54.5 
 
 
229 aa  198  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723176  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5378  transcriptional regulator, ArsR family  50.71 
 
 
215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2803  ArsR family transcriptional regulator  34.39 
 
 
269 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 
254 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
255 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  36 
 
 
254 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  32.07 
 
 
258 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
257 aa  89  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  32.92 
 
 
270 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
270 aa  86.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  30.29 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  33.08 
 
 
174 aa  71.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2860  arsenate reductase  35.56 
 
 
163 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.796184  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2481  protein tyrosine phosphatase  35.56 
 
 
163 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  36.22 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.1 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  38.14 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  37.14 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1980  protein tyrosine phosphatase  37.3 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221335  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  35.88 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  26.76 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
291 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  37.86 
 
 
144 aa  63.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  34.55 
 
 
145 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.15 
 
 
164 aa  63.2  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.68 
 
 
165 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  35.45 
 
 
142 aa  63.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  37.29 
 
 
158 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  32.84 
 
 
156 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 
165 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6165  protein tyrosine phosphatase  35.09 
 
 
164 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.237527 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.59 
 
 
143 aa  62.4  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  35.9 
 
 
142 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
284 aa  62.4  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.46 
 
 
164 aa  62  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
317 aa  62  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35100  arsenate reductase  36.36 
 
 
156 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772564  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.21 
 
 
168 aa  61.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.261916  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1641  protein tyrosine phosphatase  26.38 
 
 
309 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  26.85 
 
 
148 aa  60.1  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3819  protein tyrosine phosphatase  35.17 
 
 
168 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2334  protein tyrosine phosphatase  35.17 
 
 
168 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.645667  normal  0.0775435 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  35.24 
 
 
142 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  35.09 
 
 
164 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2962  arsenate reductase  36.7 
 
 
156 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.11 
 
 
142 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25910  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.56 
 
 
156 aa  59.7  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 
149 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  29.2 
 
 
133 aa  58.9  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  34.11 
 
 
169 aa  59.3  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  36.79 
 
 
142 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  35.96 
 
 
164 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.18 
 
 
140 aa  58.9  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  39.64 
 
 
139 aa  58.9  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6329  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
164 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720558  normal  0.0816451 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.29 
 
 
152 aa  58.5  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  37.31 
 
 
151 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  32.09 
 
 
150 aa  58.2  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  33.63 
 
 
162 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  27.82 
 
 
298 aa  58.5  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.21 
 
 
164 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  32.73 
 
 
142 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  36.45 
 
 
164 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0533  arsenate reductase, putative  35.07 
 
 
171 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  31.25 
 
 
134 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  32 
 
 
134 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0826  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  35.97 
 
 
154 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5707  protein tyrosine phosphatase  30.99 
 
 
164 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  27.01 
 
 
150 aa  57  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0756  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
153 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.686448  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5600  protein tyrosine phosphatase  32.54 
 
 
164 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123028  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  29.23 
 
 
135 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  34.58 
 
 
165 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  30.36 
 
 
131 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  31.5 
 
 
145 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  28.87 
 
 
148 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3666  protein tyrosine phosphatase  33.9 
 
 
160 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1112  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.14 
 
 
153 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.988044  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.34 
 
 
138 aa  56.6  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  32.23 
 
 
165 aa  56.2  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  32 
 
 
134 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2898  arsenate reductase  30.47 
 
 
134 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.871154  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  26.95 
 
 
145 aa  56.2  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.81 
 
 
141 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0819  radical SAM family protein  29.84 
 
 
125 aa  56.2  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2105  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  35.24 
 
 
588 aa  56.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00514129  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0653  protein tyrosine phosphatase  34.56 
 
 
168 aa  56.2  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.448039  normal  0.447799 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  32 
 
 
134 aa  55.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3821  protein tyrosine phosphatase  27.34 
 
 
138 aa  55.8  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2336  protein tyrosine phosphatase  27.34 
 
 
138 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0739912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>