More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3821 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3821  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 138 aa  285  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2336  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 138 aa  285  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0739912 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1219  protein tyrosine phosphatase  89.13 
 
 		 138 aa  259  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  49.62 
 
 		 270 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  51.91 
 
 		 275 aa  149  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 258 aa  144  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13220  protein-tyrosine-phosphatase  40.6 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3552  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.7 
 
 		 305 aa  122  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1484  protein tyrosine phosphatase  42.96 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  42.22 
 
 		 248 aa  117  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 258 aa  107  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  39.64 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  41.09 
 
 		 258 aa  106  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.94 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.89 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.64 
 
 		 152 aa  103  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.89 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  35.82 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  35.56 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.78 
 
 		 143 aa  98.6  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.43 
 
 		 137 aa  97.8  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.92 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 270 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  35.43 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  41.59 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.61 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  41.48 
 
 		 270 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2540  protein tyrosine phosphatase  39.26 
 
 		 179 aa  94  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.232269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  36.94 
 
 		 143 aa  93.2  9e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 		 169 aa  93.2  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  37.4 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  36.36 
 
 		 317 aa  92.8  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  35.34 
 
 		 164 aa  91.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  36.09 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 257 aa  91.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  36.15 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  37.12 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  39.82 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 287 aa  89  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  40.54 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 276 aa  88.2  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  35.92 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  37.21 
 
 		 132 aa  87.4  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.08 
 
 		 138 aa  87.4  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  35.86 
 
 		 166 aa  87.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2966  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 		 165 aa  87.4  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.45 
 
 		 146 aa  87  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.33 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  38.89 
 
 		 175 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.54 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 317 aa  86.3  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  37.04 
 
 		 175 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4073  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713797  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0216  protein tyrosine phosphatase  35.66 
 
 		 178 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3419  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.66 
 
 		 175 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  32.31 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.78 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1787  protein tyrosine phosphatase  32.88 
 
 		 179 aa  84.3  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981569 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2588  protein tyrosine phosphatase  34.48 
 
 		 167 aa  84.3  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.570758  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.99 
 
 		 175 aa  84  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3466  protein tyrosine phosphatase  36.3 
 
 		 168 aa  84  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  34.92 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.5 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  34.27 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.99 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  30.3 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  37.21 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  34.97 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0054  protein tyrosine phosphatase  35.14 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  37.04 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  34.81 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  35.21 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3200  protein tyrosine phosphatase  34.27 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  32.31 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  36.04 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  31.82 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  34.27 
 
 		 171 aa  80.5  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  36.64 
 
 		 141 aa  80.1  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.58 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0618  protein tyrosine phosphatase  34.97 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  30.07 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  34.81 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  32.28 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2803  ArsR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  33.58 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 		 298 aa  78.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  33.07 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  33.07 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.84 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.261916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 284 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2062  arsenate reductase  33.07 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.33 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  34.33 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  33.07 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2516  protein tyrosine phosphatase  34.04 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2602  arsenate reductase  35.59 
 
 		 188 aa  77  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000913813  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  34.81 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>