More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1780 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 154 aa  320  4e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  50.7 
 
 		 148 aa  157  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  53.62 
 
 		 143 aa  156  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  53.9 
 
 		 148 aa  156  9e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  50.7 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  51.72 
 
 		 147 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.72 
 
 		 139 aa  150  8e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  49.29 
 
 		 144 aa  149  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  48.91 
 
 		 144 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.11 
 
 		 138 aa  142  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.06 
 
 		 139 aa  140  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  46.51 
 
 		 138 aa  134  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.21 
 
 		 137 aa  131  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  51.97 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50 
 
 		 143 aa  124  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  45.65 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  49.23 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.88 
 
 		 137 aa  120  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  44.93 
 
 		 143 aa  120  9e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  47.06 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.88 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.44 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  41.38 
 
 		 145 aa  118  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  46.15 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  48.53 
 
 		 139 aa  117  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.75 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  44.85 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  43.48 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  46.15 
 
 		 139 aa  110  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.8 
 
 		 138 aa  110  7.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.86 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  44.7 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  42.96 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  43.07 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0054  protein tyrosine phosphatase  41.54 
 
 		 146 aa  104  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1112  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.33 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.988044  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  46.97 
 
 		 299 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  43.28 
 
 		 143 aa  103  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.31 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  39.29 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1707  arsenate reductase  40 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0993958  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  41.22 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  44.29 
 
 		 145 aa  100  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0756  protein tyrosine phosphatase  41.22 
 
 		 153 aa  101  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.686448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  43.18 
 
 		 151 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0826  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  40.69 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  38.82 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  42.11 
 
 		 132 aa  99.4  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.86 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 258 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  42.31 
 
 		 142 aa  97.8  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.7 
 
 		 299 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  43.8 
 
 		 142 aa  97.8  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  43.07 
 
 		 142 aa  97.8  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  44.7 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2548  protein tyrosine phosphatase  39.46 
 
 		 153 aa  97.4  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.413885  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 258 aa  95.9  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2602  arsenate reductase  36.91 
 
 		 188 aa  96.3  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000913813  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  43.07 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  49.02 
 
 		 258 aa  94.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2768  protein tyrosine phosphatase  38.26 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  44.03 
 
 		 144 aa  93.6  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  41.01 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  39.44 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  39.42 
 
 		 142 aa  92  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.8 
 
 		 142 aa  91.7  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.21 
 
 		 146 aa  91.3  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  36.03 
 
 		 148 aa  91.3  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2062  arsenate reductase  36.76 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  35.04 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.97 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 275 aa  89  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  38.97 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  43.81 
 
 		 270 aa  87.8  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  44.55 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  37.23 
 
 		 134 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  36.03 
 
 		 134 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  37.23 
 
 		 134 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  36.03 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.27 
 
 		 287 aa  87  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  41.27 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  36.03 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  36.03 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2898  arsenate reductase  36.03 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.871154  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 257 aa  86.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  37.23 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0314  arsenate reductase  39.22 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 177 aa  84.7  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  35.46 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0820  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.580395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3196  arsenate reductase  35.46 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9959  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  37.88 
 
 		 143 aa  84.3  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 255 aa  84  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  38.3 
 
 		 151 aa  84  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  35.34 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3821  protein tyrosine phosphatase  32.31 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2336  protein tyrosine phosphatase  32.31 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0739912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2722  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  37.96 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>