More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0842 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
138 aa  288  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  63.04 
 
 
140 aa  189  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  58.21 
 
 
152 aa  176  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  60.31 
 
 
140 aa  173  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52.55 
 
 
137 aa  153  6e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  51.52 
 
 
145 aa  148  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  55.04 
 
 
139 aa  145  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  52.71 
 
 
143 aa  142  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  53.49 
 
 
164 aa  140  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  51.52 
 
 
148 aa  140  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.61 
 
 
143 aa  140  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  53.79 
 
 
147 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  51.59 
 
 
144 aa  138  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  54.96 
 
 
139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.97 
 
 
138 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  52.31 
 
 
150 aa  136  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  53.54 
 
 
139 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  52.31 
 
 
144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  51.56 
 
 
142 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  56.25 
 
 
142 aa  130  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.06 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.67 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.03 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.03 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  47.37 
 
 
143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  54.78 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  47.73 
 
 
144 aa  127  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.18 
 
 
138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  53.91 
 
 
142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  44.62 
 
 
150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  46.03 
 
 
145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.94 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  44.7 
 
 
142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  49.61 
 
 
144 aa  124  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  52 
 
 
144 aa  124  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  43.31 
 
 
138 aa  124  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.78 
 
 
144 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.96 
 
 
146 aa  122  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  46.97 
 
 
148 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  45.74 
 
 
142 aa  121  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
132 aa  121  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  47.62 
 
 
131 aa  120  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  48.84 
 
 
145 aa  120  5e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.67 
 
 
141 aa  120  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  43.85 
 
 
143 aa  120  9e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  49.6 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3196  arsenate reductase  49.6 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9959  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0054  protein tyrosine phosphatase  41.04 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  49.6 
 
 
134 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2602  arsenate reductase  43.51 
 
 
188 aa  118  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000913813  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  46.15 
 
 
154 aa  118  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  49.6 
 
 
134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  48.8 
 
 
134 aa  117  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  48.8 
 
 
134 aa  117  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  48.8 
 
 
134 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  47.66 
 
 
142 aa  116  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  48.8 
 
 
148 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  49.6 
 
 
134 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2898  arsenate reductase  48.8 
 
 
134 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.871154  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  48.8 
 
 
134 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  40.74 
 
 
154 aa  113  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 
127 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2062  arsenate reductase  48 
 
 
134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  43.41 
 
 
140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  45.74 
 
 
138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  46.02 
 
 
258 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  47.15 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  45.38 
 
 
299 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.62 
 
 
299 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  45.24 
 
 
132 aa  110  8.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  45.04 
 
 
144 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.8 
 
 
287 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  46.02 
 
 
258 aa  109  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  44.8 
 
 
174 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  41.54 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  42.45 
 
 
145 aa  108  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.77 
 
 
142 aa  107  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  42.31 
 
 
141 aa  107  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  46.09 
 
 
149 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  43.9 
 
 
143 aa  107  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1707  arsenate reductase  43.2 
 
 
134 aa  104  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0993958  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  41.38 
 
 
148 aa  105  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1112  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.24 
 
 
153 aa  103  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.988044  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2768  protein tyrosine phosphatase  48.06 
 
 
153 aa  103  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  41.3 
 
 
151 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.48 
 
 
157 aa  100  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3780  protein tyrosine phosphatase  44.44 
 
 
167 aa  99.8  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0223758  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2184  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.75 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000653418  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5673  protein tyrosine phosphatase  41.79 
 
 
164 aa  98.2  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6164  protein tyrosine phosphatase  40.3 
 
 
164 aa  97.4  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.398136 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6562  protein tyrosine phosphatase  41.04 
 
 
168 aa  97.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4215  protein tyrosine phosphatase  39.55 
 
 
164 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3255  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.77 
 
 
172 aa  97.1  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  44.19 
 
 
166 aa  96.7  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0756  protein tyrosine phosphatase  44.96 
 
 
153 aa  96.7  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.686448  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1579  protein tyrosine phosphatase  41.04 
 
 
159 aa  96.7  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2401  protein tyrosine phosphatase  36.84 
 
 
169 aa  96.3  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  46.96 
 
 
165 aa  95.5  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1128  putative arsenate reductase (arsenical PUMP modifier) protein  38.81 
 
 
164 aa  95.5  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2548  protein tyrosine phosphatase  46.51 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.413885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>