More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1874 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  100 
 
 
144 aa  298  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  81.88 
 
 
142 aa  243  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  61.59 
 
 
142 aa  184  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.45 
 
 
157 aa  153  7e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  49.26 
 
 
150 aa  147  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.74 
 
 
143 aa  147  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.04 
 
 
146 aa  142  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  49.63 
 
 
139 aa  142  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.51 
 
 
140 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.41 
 
 
152 aa  134  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0845  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50 
 
 
143 aa  133  9e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000114358  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  43.88 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  42.96 
 
 
154 aa  131  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  46.92 
 
 
143 aa  130  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  43.7 
 
 
150 aa  126  9.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  44.44 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  46.9 
 
 
143 aa  124  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.22 
 
 
139 aa  122  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  47.24 
 
 
132 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  44.78 
 
 
138 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1579  protein tyrosine phosphatase  43.28 
 
 
159 aa  120  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 
143 aa  120  9e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  41.79 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  42.45 
 
 
165 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.43 
 
 
164 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  42.34 
 
 
164 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  39.01 
 
 
164 aa  117  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.42 
 
 
137 aa  117  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  45.04 
 
 
132 aa  117  6e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.04 
 
 
137 aa  117  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  42.45 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.79 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.79 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.01 
 
 
138 aa  115  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  44.27 
 
 
139 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  40.27 
 
 
148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  42.66 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.04 
 
 
141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  42.07 
 
 
145 aa  114  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  40.43 
 
 
287 aa  113  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  43.15 
 
 
144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  46.96 
 
 
258 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  40.46 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  40.3 
 
 
144 aa  111  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.22 
 
 
299 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  42.75 
 
 
144 aa  111  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  41.61 
 
 
144 aa  110  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2792  protein tyrosine phosphatase  43.33 
 
 
146 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  38.89 
 
 
145 aa  110  9e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  45.07 
 
 
141 aa  110  9e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  41.73 
 
 
166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  42.98 
 
 
165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  41.22 
 
 
299 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  41.61 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3826  protein tyrosine phosphatase  38.85 
 
 
167 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.248837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.85 
 
 
167 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117198 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  40.82 
 
 
145 aa  108  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  44.09 
 
 
140 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  35.46 
 
 
165 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  40.58 
 
 
144 aa  107  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  36.17 
 
 
165 aa  107  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
140 aa  107  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5346  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.88 
 
 
164 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.524005 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  44.78 
 
 
142 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
255 aa  107  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  43.17 
 
 
148 aa  106  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.46 
 
 
165 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  47.29 
 
 
145 aa  106  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  39.55 
 
 
276 aa  105  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  40.69 
 
 
144 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2516  protein tyrosine phosphatase  39.29 
 
 
165 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1344  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.29 
 
 
165 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.230877  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  37.59 
 
 
170 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  43.22 
 
 
149 aa  104  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6164  protein tyrosine phosphatase  40.15 
 
 
164 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.398136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3255  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.15 
 
 
172 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  41.13 
 
 
147 aa  104  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  37.68 
 
 
174 aa  104  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  39.26 
 
 
143 aa  104  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  35.25 
 
 
162 aa  104  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  43.28 
 
 
142 aa  103  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0756  protein tyrosine phosphatase  40.43 
 
 
153 aa  103  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.686448  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
270 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  38.69 
 
 
171 aa  103  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2768  protein tyrosine phosphatase  40.71 
 
 
153 aa  103  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5708  protein tyrosine phosphatase  39.42 
 
 
164 aa  103  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  34.04 
 
 
164 aa  103  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5765  protein tyrosine phosphatase  40.6 
 
 
164 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6562  protein tyrosine phosphatase  38.69 
 
 
168 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4215  protein tyrosine phosphatase  38.69 
 
 
164 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.67 
 
 
287 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  36.43 
 
 
270 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.29 
 
 
139 aa  102  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1128  putative arsenate reductase (arsenical PUMP modifier) protein  38.69 
 
 
164 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  44.26 
 
 
127 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6329  protein tyrosine phosphatase  38.69 
 
 
164 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720558  normal  0.0816451 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1820  protein tyrosine phosphatase  40.15 
 
 
164 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.102898 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  35.77 
 
 
164 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.06 
 
 
138 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5600  protein tyrosine phosphatase  38.69 
 
 
164 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123028  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>