More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1219 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1219  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 138 aa  288  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3821  protein tyrosine phosphatase  89.13 
 
 		 138 aa  259  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2336  protein tyrosine phosphatase  89.13 
 
 		 138 aa  259  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0739912 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  51.91 
 
 		 275 aa  148  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  49.63 
 
 		 270 aa  148  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 258 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13220  protein-tyrosine-phosphatase  41.35 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3552  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.19 
 
 		 305 aa  125  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  41.91 
 
 		 248 aa  117  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1484  protein tyrosine phosphatase  42.65 
 
 		 138 aa  117  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 258 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  47.12 
 
 		 258 aa  107  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  34.33 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  34.81 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.16 
 
 		 139 aa  97.4  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  41.48 
 
 		 317 aa  96.7  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.51 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 270 aa  95.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  40.71 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  37.61 
 
 		 139 aa  93.6  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.71 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.04 
 
 		 152 aa  92.8  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.71 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.62 
 
 		 137 aa  92  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 257 aa  92  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 270 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 175 aa  90.9  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  33.86 
 
 		 138 aa  90.5  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4073  protein tyrosine phosphatase  38.57 
 
 		 175 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713797  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  40.54 
 
 		 154 aa  90.5  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2540  protein tyrosine phosphatase  37.78 
 
 		 179 aa  90.1  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.232269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.65 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  38.52 
 
 		 179 aa  89.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  36.94 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  39.86 
 
 		 175 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.09 
 
 		 140 aa  88.2  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0216  protein tyrosine phosphatase  37.06 
 
 		 178 aa  88.2  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.86 
 
 		 175 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  38.52 
 
 		 169 aa  87.8  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  34.33 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 317 aa  87.8  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0618  protein tyrosine phosphatase  38.57 
 
 		 175 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.45 
 
 		 146 aa  87.4  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.86 
 
 		 175 aa  87  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  37.14 
 
 		 166 aa  87  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1425  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 141 aa  86.7  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3200  protein tyrosine phosphatase  37.23 
 
 		 182 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.07 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1787  protein tyrosine phosphatase  35.77 
 
 		 179 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3419  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.14 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2966  protein tyrosine phosphatase  39.26 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  38.05 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  38.52 
 
 		 165 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  33.59 
 
 		 138 aa  84  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  36.23 
 
 		 165 aa  83.6  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2588  protein tyrosine phosphatase  35.46 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.570758  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0875  protein tyrosine phosphatase  37.04 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5056  protein tyrosine phosphatase  35.04 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.04 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  35.56 
 
 		 287 aa  80.9  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 276 aa  80.9  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  37.78 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0054  protein tyrosine phosphatase  35.14 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2516  protein tyrosine phosphatase  41.07 
 
 		 165 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0325  protein tyrosine phosphatase  35.82 
 
 		 175 aa  80.1  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1344  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.44 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.230877  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  31.54 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  35.56 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.56 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  30.83 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4381  protein tyrosine phosphatase  36.11 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3124  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.04 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.641523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  39.62 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35100  arsenate reductase  34.59 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.84 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 284 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  29.69 
 
 		 254 aa  77.8  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  34.81 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  29.55 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2415  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.56 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.214614 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  35.14 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.07 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5707  protein tyrosine phosphatase  39.62 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  36.3 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.71 
 
 		 138 aa  76.6  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00628  arsenate reductase  36.69 
 
 		 176 aa  77  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.102158  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0653  protein tyrosine phosphatase  33.56 
 
 		 168 aa  76.6  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.448039  normal  0.447799 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.58 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  35.56 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  34.81 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6165  protein tyrosine phosphatase  39.29 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.237527 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  34.11 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  34.81 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3466  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  36.03 
 
 		 295 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.387678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>