More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2315 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 258 aa  532  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  72.09 
 
 		 258 aa  384  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 257 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50 
 
 		 152 aa  142  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.16 
 
 		 143 aa  141  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2803  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52 
 
 		 140 aa  131  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  49.23 
 
 		 139 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  46.43 
 
 		 165 aa  126  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  50.88 
 
 		 150 aa  125  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45 
 
 		 165 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.43 
 
 		 164 aa  122  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  46.43 
 
 		 162 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.43 
 
 		 138 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  47.76 
 
 		 165 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.33 
 
 		 138 aa  119  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  45.71 
 
 		 165 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.51 
 
 		 137 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  49.12 
 
 		 143 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  46.43 
 
 		 141 aa  116  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  44.3 
 
 		 169 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  41.89 
 
 		 164 aa  115  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  42.67 
 
 		 165 aa  115  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  46.15 
 
 		 142 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.67 
 
 		 146 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  44.96 
 
 		 142 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  44.27 
 
 		 151 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  43.66 
 
 		 142 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  54.29 
 
 		 140 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.85 
 
 		 139 aa  112  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.96 
 
 		 144 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.98 
 
 		 137 aa  112  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  46.02 
 
 		 138 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.98 
 
 		 137 aa  111  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  43.48 
 
 		 179 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  44.53 
 
 		 164 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5707  protein tyrosine phosphatase  43.7 
 
 		 164 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  32.85 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00628  arsenate reductase  44.14 
 
 		 176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.102158  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2540  protein tyrosine phosphatase  42.28 
 
 		 179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.232269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 138 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  36.43 
 
 		 150 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  43.18 
 
 		 142 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6165  protein tyrosine phosphatase  43.18 
 
 		 164 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.237527 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  40.15 
 
 		 154 aa  108  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  34.44 
 
 		 270 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  50.94 
 
 		 145 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  45.26 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  45.19 
 
 		 151 aa  107  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  46.21 
 
 		 142 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  44.88 
 
 		 149 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1219  protein tyrosine phosphatase  39.29 
 
 		 138 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3821  protein tyrosine phosphatase  38.57 
 
 		 138 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2336  protein tyrosine phosphatase  38.57 
 
 		 138 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0739912 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.06 
 
 		 175 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  44.68 
 
 		 175 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  43.94 
 
 		 142 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.53 
 
 		 175 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  44.53 
 
 		 175 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  45.38 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  42.42 
 
 		 170 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  42.75 
 
 		 177 aa  106  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4073  protein tyrosine phosphatase  43.48 
 
 		 175 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713797  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0653  protein tyrosine phosphatase  38.26 
 
 		 168 aa  105  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.448039  normal  0.447799 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  45.19 
 
 		 144 aa  105  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  42.42 
 
 		 144 aa  105  7e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.02 
 
 		 141 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  41.79 
 
 		 164 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  32.94 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  37.58 
 
 		 171 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  47.12 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3200  protein tyrosine phosphatase  44.2 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.14 
 
 		 168 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.261916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  44.96 
 
 		 143 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  34.54 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.43 
 
 		 164 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.85 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  48.57 
 
 		 143 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  48.57 
 
 		 140 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  40.14 
 
 		 164 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 132 aa  102  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3419  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.03 
 
 		 175 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3124  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.48 
 
 		 180 aa  102  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.641523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0585  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.61 
 
 		 177 aa  102  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5093  protein tyrosine phosphatase  34.75 
 
 		 225 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  41.01 
 
 		 145 aa  102  8e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.85 
 
 		 164 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5056  protein tyrosine phosphatase  40.29 
 
 		 175 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  46.15 
 
 		 145 aa  101  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0875  protein tyrosine phosphatase  42.03 
 
 		 189 aa  102  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0618  protein tyrosine phosphatase  41.61 
 
 		 175 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3826  protein tyrosine phosphatase  40.14 
 
 		 167 aa  101  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.248837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.14 
 
 		 167 aa  101  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117198 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  38.81 
 
 		 143 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>