More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1425 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1425  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 141 aa  284  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2184  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.06 
 
 		 133 aa  122  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000653418  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0314  arsenate reductase  46.51 
 
 		 132 aa  120  5e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  43.61 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.21 
 
 		 138 aa  108  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  38.85 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  42.64 
 
 		 142 aa  100  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  41.3 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  40.74 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  38.41 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  44.19 
 
 		 254 aa  95.5  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.62 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 		 150 aa  94  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.48 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.53 
 
 		 138 aa  94  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.46 
 
 		 152 aa  90.9  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  41.04 
 
 		 143 aa  90.5  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  36.5 
 
 		 142 aa  90.5  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40 
 
 		 139 aa  90.1  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.57 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  40.32 
 
 		 138 aa  88.2  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  39.84 
 
 		 138 aa  88.2  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1344  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.55 
 
 		 165 aa  87.4  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.230877  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4381  protein tyrosine phosphatase  48.25 
 
 		 171 aa  87  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0756  protein tyrosine phosphatase  40.6 
 
 		 153 aa  87.4  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.686448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  37.4 
 
 		 144 aa  87  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1219  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 138 aa  86.7  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2516  protein tyrosine phosphatase  42.55 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1928  arsenate reductase  45.71 
 
 		 162 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245596  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  40.16 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  37.31 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.75 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  37.5 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  36.17 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.8 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  36.09 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  42.75 
 
 		 170 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5377  protein tyrosine phosphatase  45.95 
 
 		 173 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  39.46 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  43.81 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  35.43 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  37.16 
 
 		 175 aa  84  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.1 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  38.76 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.35 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  40.94 
 
 		 165 aa  84  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  42.73 
 
 		 164 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2548  protein tyrosine phosphatase  40.77 
 
 		 153 aa  83.6  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.413885  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 257 aa  83.6  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3200  protein tyrosine phosphatase  36.84 
 
 		 182 aa  83.6  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  37.01 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  38.41 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  36.92 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  39.71 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.51 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  36.22 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.13 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  36.22 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  36.22 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2898  arsenate reductase  36.22 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.871154  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  41.86 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  36.22 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2768  protein tyrosine phosphatase  39.23 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  37.12 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  36.22 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  42.11 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  37.14 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0207  protein tyrosine phosphatase  39.86 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.538928 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0216  protein tyrosine phosphatase  40.16 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2588  protein tyrosine phosphatase  41.96 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.570758  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.69 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0875  protein tyrosine phosphatase  37.59 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  35.21 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  33.33 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.06 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 291 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  42.59 
 
 		 248 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  37.59 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2398  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798695 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  45.05 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  36.22 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  39.84 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3196  arsenate reductase  36.22 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9959  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2716  arsenate reductase  40 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0618  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 		 175 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2062  arsenate reductase  36.59 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0325  protein tyrosine phosphatase  40.74 
 
 		 175 aa  80.5  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  36.03 
 
 		 154 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  34.65 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  38.58 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.82 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3036  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  35.88 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.77 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0826  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  42.28 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6562  protein tyrosine phosphatase  36.3 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1112  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.46 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.988044  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25910  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.9 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  39.39 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  39.85 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>