More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0314 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0314  arsenate reductase  100 
 
 
132 aa  266  5e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2184  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  58.46 
 
 
133 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000653418  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1425  protein tyrosine phosphatase  46.51 
 
 
141 aa  120  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694751  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.93 
 
 
137 aa  104  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  52.88 
 
 
138 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.88 
 
 
152 aa  98.6  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  50.96 
 
 
144 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
148 aa  97.1  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  42.52 
 
 
144 aa  97.1  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.41 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.53 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
145 aa  94.7  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  42.64 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  38.17 
 
 
142 aa  94.4  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  41.09 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  39.23 
 
 
148 aa  93.6  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  38.58 
 
 
144 aa  93.6  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.65 
 
 
137 aa  93.2  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.91 
 
 
137 aa  92.8  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.71 
 
 
141 aa  92.8  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  38.17 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  35.97 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1112  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.8 
 
 
153 aa  91.3  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.988044  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  45.76 
 
 
165 aa  90.1  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  37.4 
 
 
142 aa  90.1  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0756  protein tyrosine phosphatase  34.35 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.686448  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.12 
 
 
139 aa  89.4  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.06 
 
 
138 aa  89  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3200  protein tyrosine phosphatase  41.22 
 
 
182 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  40.6 
 
 
145 aa  88.2  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  41.6 
 
 
165 aa  87.8  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  45.79 
 
 
143 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2548  protein tyrosine phosphatase  34.09 
 
 
153 aa  87  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.413885  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0325  protein tyrosine phosphatase  39.57 
 
 
175 aa  87  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  41.09 
 
 
174 aa  86.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.75 
 
 
165 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0826  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  39.34 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  38.93 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
156 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  39.22 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  43.81 
 
 
162 aa  84.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  38.17 
 
 
171 aa  84.3  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35100  arsenate reductase  42.86 
 
 
156 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772564  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2962  arsenate reductase  42.86 
 
 
156 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25910  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.02 
 
 
156 aa  84  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  42.06 
 
 
164 aa  84  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.93 
 
 
164 aa  84  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6562  protein tyrosine phosphatase  41.27 
 
 
168 aa  83.6  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0207  protein tyrosine phosphatase  41.1 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.538928 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  38.58 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.86 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5377  protein tyrosine phosphatase  40.77 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  41.96 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2768  protein tyrosine phosphatase  33.59 
 
 
153 aa  82  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.43 
 
 
140 aa  82  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0618  protein tyrosine phosphatase  40.52 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
284 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3124  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.38 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.641523  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  39.84 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  39.69 
 
 
291 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  42.64 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0875  protein tyrosine phosphatase  38.17 
 
 
189 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0216  protein tyrosine phosphatase  41.51 
 
 
178 aa  80.9  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1344  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.85 
 
 
165 aa  80.5  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.230877  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.23 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0959  arsenate reductase  40.71 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2516  protein tyrosine phosphatase  39.85 
 
 
165 aa  80.5  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  35.97 
 
 
158 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3466  protein tyrosine phosphatase  42.74 
 
 
168 aa  80.1  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0653  protein tyrosine phosphatase  39.26 
 
 
168 aa  80.1  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.448039  normal  0.447799 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  39.84 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1928  arsenate reductase  41.73 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245596  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6329  protein tyrosine phosphatase  34.01 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720558  normal  0.0816451 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  39.84 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.4 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.261916  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
317 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  39.84 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  43.1 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5708  protein tyrosine phosphatase  35.37 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  39.84 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  39.84 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
179 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2062  arsenate reductase  41.18 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  41.9 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  42.45 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0585  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.23 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3196  arsenate reductase  39.84 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9959  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  36.43 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5765  protein tyrosine phosphatase  39.82 
 
 
164 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5600  protein tyrosine phosphatase  34.01 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123028  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  39.37 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1128  putative arsenate reductase (arsenical PUMP modifier) protein  40.71 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  37.86 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.35 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  38.21 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3780  protein tyrosine phosphatase  37.31 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0223758  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2540  protein tyrosine phosphatase  40.19 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.232269  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5673  protein tyrosine phosphatase  37.3 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  39.84 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0533  arsenate reductase, putative  35.77 
 
 
171 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>