More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2881 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
145 aa  304  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  61.27 
 
 
148 aa  186  8e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  61.27 
 
 
143 aa  186  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  65.67 
 
 
144 aa  185  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  62.77 
 
 
139 aa  184  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  60.71 
 
 
147 aa  184  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  55.94 
 
 
144 aa  169  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  57.55 
 
 
148 aa  167  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  50.7 
 
 
154 aa  154  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  61.24 
 
 
139 aa  150  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  51.52 
 
 
138 aa  148  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.82 
 
 
138 aa  146  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  53.12 
 
 
164 aa  138  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  53.49 
 
 
140 aa  135  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  53.49 
 
 
144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  51.16 
 
 
140 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  52.67 
 
 
139 aa  132  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.48 
 
 
152 aa  130  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  52.31 
 
 
148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  50 
 
 
131 aa  128  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  52.67 
 
 
134 aa  128  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  52.67 
 
 
134 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2062  arsenate reductase  48.15 
 
 
134 aa  128  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.03 
 
 
143 aa  127  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  50.38 
 
 
134 aa  127  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
142 aa  126  8.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  52.67 
 
 
134 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  54.76 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  45.04 
 
 
138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  49.62 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  49.62 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  46.76 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  50.77 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.51 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  48.85 
 
 
134 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  50.38 
 
 
134 aa  124  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2898  arsenate reductase  49.62 
 
 
134 aa  125  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.871154  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3196  arsenate reductase  50.38 
 
 
134 aa  124  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9959  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.62 
 
 
138 aa  124  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  52.46 
 
 
132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.14 
 
 
140 aa  124  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  46.32 
 
 
151 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  46.97 
 
 
145 aa  122  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  44.37 
 
 
140 aa  121  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  45.93 
 
 
143 aa  121  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  45.71 
 
 
144 aa  121  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.96 
 
 
141 aa  121  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  50 
 
 
138 aa  121  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  49.23 
 
 
142 aa  120  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 
150 aa  120  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.96 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.96 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.96 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  48.51 
 
 
141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  46.51 
 
 
142 aa  116  9e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.97 
 
 
299 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  46.97 
 
 
132 aa  114  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  45.74 
 
 
144 aa  114  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  44.27 
 
 
143 aa  114  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  46.21 
 
 
299 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.31 
 
 
287 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  48.31 
 
 
149 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  42.03 
 
 
142 aa  110  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  43.75 
 
 
142 aa  110  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  40.44 
 
 
150 aa  110  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.67 
 
 
137 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1707  arsenate reductase  45.11 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0993958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.82 
 
 
144 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  39.31 
 
 
143 aa  107  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  42.22 
 
 
144 aa  104  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  43.48 
 
 
151 aa  104  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  43.94 
 
 
132 aa  103  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.19 
 
 
142 aa  102  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2184  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.51 
 
 
133 aa  102  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000653418  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
258 aa  101  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.35 
 
 
146 aa  100  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  41.3 
 
 
144 aa  100  9e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1112  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.98 
 
 
153 aa  99  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.988044  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
254 aa  98.2  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0054  protein tyrosine phosphatase  39.55 
 
 
146 aa  97.4  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2141  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.03 
 
 
159 aa  97.8  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0826  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  40.77 
 
 
154 aa  97.4  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  45.19 
 
 
258 aa  97.1  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3186  arsenate reductase (thioredoxin)  45.54 
 
 
115 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  44.36 
 
 
284 aa  95.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  37.31 
 
 
156 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0820  protein tyrosine phosphatase  39.71 
 
 
150 aa  93.6  8e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.580395  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  38.03 
 
 
145 aa  93.6  8e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  38.03 
 
 
148 aa  93.2  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  34.59 
 
 
154 aa  92.8  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  41.41 
 
 
174 aa  93.2  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3666  protein tyrosine phosphatase  40.3 
 
 
160 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25910  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.04 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  40.88 
 
 
133 aa  90.9  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3381  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  38.69 
 
 
130 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2398  protein tyrosine phosphatase  37.31 
 
 
156 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2722  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  38.69 
 
 
130 aa  90.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
255 aa  90.5  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1928  arsenate reductase  34.75 
 
 
162 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245596  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2602  arsenate reductase  34.23 
 
 
188 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000913813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>