More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2184 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2184  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  100 
 
 
133 aa  272  1.0000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000653418  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0314  arsenate reductase  58.46 
 
 
132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1425  protein tyrosine phosphatase  48.06 
 
 
141 aa  122  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694751  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  49.51 
 
 
145 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.54 
 
 
139 aa  102  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  43.75 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52.38 
 
 
138 aa  99.4  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  47.57 
 
 
148 aa  97.1  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 
145 aa  97.1  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  47.06 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  47.57 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.67 
 
 
139 aa  94.4  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.11 
 
 
137 aa  94.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  46.6 
 
 
147 aa  94  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  44.23 
 
 
142 aa  93.6  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  43.14 
 
 
144 aa  92.8  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  45.71 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.54 
 
 
152 aa  92  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  44.34 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3826  protein tyrosine phosphatase  41.01 
 
 
167 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.248837 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  49.52 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.01 
 
 
167 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117198 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6562  protein tyrosine phosphatase  42.45 
 
 
168 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  41.9 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0959  arsenate reductase  41.01 
 
 
164 aa  89.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.67 
 
 
137 aa  90.1  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.39 
 
 
137 aa  90.1  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3255  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.73 
 
 
172 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  47.12 
 
 
144 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  44.23 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5708  protein tyrosine phosphatase  41.01 
 
 
164 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5673  protein tyrosine phosphatase  41.73 
 
 
164 aa  88.2  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4215  protein tyrosine phosphatase  41.01 
 
 
164 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1128  putative arsenate reductase (arsenical PUMP modifier) protein  39.16 
 
 
164 aa  88.2  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6164  protein tyrosine phosphatase  41.01 
 
 
164 aa  87.8  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.398136 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4965  protein tyrosine phosphatase  41.3 
 
 
172 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219963  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3195  protein tyrosine phosphatase  41.3 
 
 
172 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0756  protein tyrosine phosphatase  45.95 
 
 
153 aa  87.8  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.686448  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.34 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3579  protein tyrosine phosphatase  39.57 
 
 
164 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.747703 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  45.19 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1928  arsenate reductase  47.22 
 
 
162 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245596  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2548  protein tyrosine phosphatase  45.95 
 
 
153 aa  85.5  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.413885  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0653  protein tyrosine phosphatase  44.04 
 
 
168 aa  85.9  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.448039  normal  0.447799 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5600  protein tyrosine phosphatase  40.29 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123028  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  41.96 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2062  arsenate reductase  41.96 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6329  protein tyrosine phosphatase  38.85 
 
 
164 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720558  normal  0.0816451 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.63 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  45.79 
 
 
165 aa  84.7  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  48.08 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0558  arsenate reductase  39.16 
 
 
164 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0569825  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0913  arsenate reductase  39.16 
 
 
164 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.910789  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1882  arsenate reductase  39.16 
 
 
164 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5346  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.57 
 
 
164 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.524005 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  46.23 
 
 
164 aa  83.6  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1112  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.55 
 
 
153 aa  83.6  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.988044  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35100  arsenate reductase  42.59 
 
 
156 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772564  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5765  protein tyrosine phosphatase  42.75 
 
 
164 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  37.4 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  41.96 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  41.07 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0456  arsenate reductase  37.76 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1942  arsenate reductase ArsC  37.76 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2037  arsenate reductase ArsC  37.76 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  43.52 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  41.07 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  41.07 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  43.27 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3119  protein tyrosine phosphatase  40.85 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  39.53 
 
 
158 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2962  arsenate reductase  42.59 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  45.19 
 
 
150 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  39.29 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  41.07 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1820  protein tyrosine phosphatase  38.13 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.102898 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3196  arsenate reductase  41.07 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9959  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  40.18 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2898  arsenate reductase  40.18 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.871154  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  40.18 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  42.86 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.93 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  44.23 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  40.18 
 
 
134 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.66 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  45.63 
 
 
140 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  39.05 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1707  arsenate reductase  40.38 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0993958  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  43.93 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0533  arsenate reductase, putative  41.9 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.93 
 
 
164 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  44.44 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  43.27 
 
 
284 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  41.79 
 
 
166 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2588  protein tyrosine phosphatase  39.85 
 
 
167 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.570758  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  42.45 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  38.76 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  39.81 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  41.51 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2860  arsenate reductase  43.27 
 
 
163 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.796184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>