More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2820 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
143 aa  297  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  61.54 
 
 
148 aa  190  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  65.93 
 
 
144 aa  189  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  61.27 
 
 
145 aa  186  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  59.71 
 
 
144 aa  180  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  64.08 
 
 
147 aa  180  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  61.15 
 
 
148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  60.29 
 
 
139 aa  167  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.49 
 
 
139 aa  156  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  53.62 
 
 
154 aa  156  8e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  54.07 
 
 
164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.68 
 
 
152 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  54.14 
 
 
139 aa  149  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.85 
 
 
137 aa  147  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  55.47 
 
 
138 aa  144  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  53.49 
 
 
132 aa  143  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  51.85 
 
 
138 aa  143  6e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  50.72 
 
 
138 aa  143  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.25 
 
 
143 aa  142  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  51.06 
 
 
150 aa  141  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.77 
 
 
140 aa  137  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  45.93 
 
 
131 aa  137  7e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  48.23 
 
 
142 aa  135  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  49.3 
 
 
140 aa  136  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  47.86 
 
 
143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  48.15 
 
 
145 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  48.51 
 
 
144 aa  133  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.75 
 
 
141 aa  132  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  50.74 
 
 
139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  50.81 
 
 
127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  50 
 
 
140 aa  130  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  48.57 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.23 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.52 
 
 
137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  47.37 
 
 
138 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.15 
 
 
137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  47.33 
 
 
134 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  47.33 
 
 
134 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  48.28 
 
 
143 aa  125  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  41.91 
 
 
148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  54.2 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  43.38 
 
 
134 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2898  arsenate reductase  42.65 
 
 
134 aa  124  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.871154  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.9 
 
 
144 aa  124  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  42.65 
 
 
134 aa  124  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  43.7 
 
 
132 aa  122  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  42.65 
 
 
134 aa  122  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  42.65 
 
 
134 aa  122  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  46.38 
 
 
143 aa  122  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  46.56 
 
 
134 aa  122  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  50.38 
 
 
145 aa  122  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2062  arsenate reductase  41.91 
 
 
134 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
144 aa  122  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  42.65 
 
 
134 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3196  arsenate reductase  42.65 
 
 
134 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9959  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  47.86 
 
 
142 aa  121  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1112  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.43 
 
 
153 aa  121  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.988044  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1707  arsenate reductase  46.27 
 
 
134 aa  120  7e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0993958  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  51.15 
 
 
142 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  44.6 
 
 
141 aa  117  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  51.15 
 
 
142 aa  115  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.48 
 
 
138 aa  116  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0826  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  48.84 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  46.1 
 
 
144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  42.03 
 
 
150 aa  114  6e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.12 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  47.33 
 
 
142 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0054  protein tyrosine phosphatase  44.19 
 
 
146 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  46.83 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  43.28 
 
 
132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  46.27 
 
 
144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.7 
 
 
287 aa  107  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0756  protein tyrosine phosphatase  43.57 
 
 
153 aa  103  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.686448  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  44.96 
 
 
258 aa  103  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  46.03 
 
 
299 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.24 
 
 
299 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  39.57 
 
 
143 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.6 
 
 
146 aa  102  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  43.48 
 
 
145 aa  100  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  50.5 
 
 
149 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  43.48 
 
 
151 aa  100  9e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
254 aa  99.4  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  40.44 
 
 
255 aa  99.4  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2768  protein tyrosine phosphatase  42.14 
 
 
153 aa  99.4  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  45.93 
 
 
287 aa  98.6  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  47.66 
 
 
258 aa  98.6  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1110  protein tyrosine phosphatase  40.88 
 
 
133 aa  97.1  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  39.1 
 
 
154 aa  96.3  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0845  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.38 
 
 
143 aa  96.7  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000114358  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2548  protein tyrosine phosphatase  41.55 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.413885  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  42.25 
 
 
498 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2105  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  44.27 
 
 
588 aa  95.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00514129  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  41.5 
 
 
144 aa  94  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  38.69 
 
 
137 aa  92  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.06 
 
 
142 aa  92  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3821  protein tyrosine phosphatase  36.09 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2184  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.52 
 
 
133 aa  91.7  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000653418  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  40.15 
 
 
254 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2336  protein tyrosine phosphatase  36.09 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0739912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  39.58 
 
 
135 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>